| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2091895 = | 68 (1.400) | 4 (0.100) | 3/86 | NT | 6.9% | intergenic (‑45/‑238) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| ? | W3110S.gb | 2091916 = | 49 (1.170) | intergenic (‑66/‑217) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide | |||||
CTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAT > W3110S.gb/2091826‑2091965 | ttagctgatggcaccaaaaatagcgaagcctggattttcgtctcactgacaataccttgatctacaaact < 1:2788922‑M1/1‑1 (MQ=255)ttagctgatggcaccaaaaatagcgaagcctggattttcgtctcactgacaataccttgatctacaaact < 1:3988687‑M1/1‑1 (MQ=255)cTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGtta < 1:2764355/71‑1 (MQ=255) tCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaat > 1:4162643/1‑71 (MQ=255) cGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaat > 1:2325841/1‑70 (MQ=255) cGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaat > 1:880520/1‑70 (MQ=255) cGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaat > 1:4415768/1‑70 (MQ=255) gCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaatt > 1:603923/1‑70 (MQ=255) gCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaatt < 1:2862883/70‑1 (MQ=255) gatggcaccaaaaatagcgaagcctggattttcgtctcactgacaataccttgatctacaaacTAATTaa < 1:2064406‑M1/7‑1 (MQ=255) tAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAAc < 1:841684/69‑1 (MQ=255) aTTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtatttatt < 1:1005601/71‑1 (MQ=255) aTTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtattta < 1:4036161/69‑1 (MQ=255) aTTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtattta < 1:2213078/69‑1 (MQ=255) ttGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACta < 1:3664345/64‑1 (MQ=255) tGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtatttatt > 1:1172730/1‑69 (MQ=255) cGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACt > 1:317736/1‑58 (MQ=255) cGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAg > 1:1371211/1‑71 (MQ=255) cATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGtt > 1:4108938/1‑71 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGtt < 1:219633/46‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:4022486/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3290073/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:4183030/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2512690/71‑1 (MQ=255) gTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3557213/70‑1 (MQ=255) gTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2063436/70‑1 (MQ=255) tCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:3909986/70‑1 (MQ=255) tCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:1072126/70‑1 (MQ=255) aaTCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtattta > 1:4010639/1‑55 (MQ=255) ctcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGttaa > 1:1590890/1‑41 (MQ=255) ctcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGtt < 1:1171552/39‑1 (MQ=255) ctcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc > 1:4484171/1‑70 (MQ=255) tcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGAt > 1:2909916/1‑68 (MQ=255) ctctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGtt < 1:2237960/36‑1 (MQ=255) ctctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc < 1:2811924/67‑1 (MQ=255) tttcgtctcactgacaataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTATTAATTAGttt < 1:2391838‑M1/25‑1 (MQ=255) tttcgtctcactgacaataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTATTAATTAGttt < 1:2397166‑M1/25‑1 (MQ=255) ctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa > 1:2397693/1‑71 (MQ=255) ctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa > 1:4342119/1‑71 (MQ=255) ttttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAAc < 1:4585715/40‑1 (MQ=255) ttttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:3376480/1‑71 (MQ=255) ttttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:4313369/1‑71 (MQ=255) tttGTACAGTTCATTGTA‑AATGATGAGCGttaattaa > 1:769208/1‑37 (MQ=38) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAAc > 1:239393/1‑38 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa < 1:439989/68‑1 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAtt < 1:2220375/70‑1 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt < 1:3851572/69‑1 (MQ=255) gTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGt < 1:2635398/70‑1 (MQ=255) tACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtatttat < 1:498053/42‑1 (MQ=255) tACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAg < 1:3992087/62‑1 (MQ=255) cAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGt < 1:3520563/71‑1 (MQ=255) cAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGt < 1:3525664/71‑1 (MQ=255) actgacaataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTattaatta < 1:260090‑M1/21‑1 (MQ=255) gTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTga < 1:4099537/71‑1 (MQ=255) ttCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACtatttat < 1:737183/37‑1 (MQ=255) ttCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTc < 1:1256072/65‑1 (MQ=255) tCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTa > 1:850153/1‑49 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTattaat > 1:448859/1‑39 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:3413275/1‑71 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:1220068/1‑71 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:3354840/1‑71 (MQ=255) aataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTattaat > 1:1549355‑M1/20‑38 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGt < 1:1977814/55‑1 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGt < 1:1577478/55‑1 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGa < 1:1499647/71‑1 (MQ=255) tGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:1427295/43‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTattaat < 1:3828794/35‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3724754/42‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2234176/42‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCa > 1:726317/1‑60 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTgaga > 1:3065239/1‑66 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaa > 1:208078/1‑70 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaa > 1:4540229/1‑70 (MQ=255) tACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaaa > 1:1861210/1‑71 (MQ=255) aCAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:2145137/1‑53 (MQ=255) cAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATc < 1:1112752/71‑1 (MQ=255) cAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATc < 1:3493881/71‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAAt > 1:4221247/1‑69 (MQ=255) aaTGATGAGCGTTAATTAACTATTGATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATcc < 1:3569728/71‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc < 1:1204190/42‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAg < 1:2940979/71‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAg < 1:1721452/71‑1 (MQ=255) gatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCa > 1:3764142/1‑53 (MQ=255) atgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:1416862/35‑1 (MQ=255) atgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAtt > 1:2103140/1‑48 (MQ=255) tgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCt < 1:2665617/71‑1 (MQ=255) aGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCtt < 1:2527102/70‑1 (MQ=255) aGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTc > 1:4122886/1‑71 (MQ=255) gCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCg > 1:1550875/1‑71 (MQ=255) cGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCg > 1:3266232/1‑70 (MQ=255) ttaattaaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAgg < 1:2297400/37‑1 (MQ=255) TAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAt < 1:484564‑M1/71‑1 (MQ=255) | CTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAT > W3110S.gb/2091826‑2091965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |