| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2091895 = | 68 (1.400) | 4 (0.100) | 3/86 | NT | 6.9% | intergenic (‑45/‑238) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| ? | W3110S.gb | 2091916 = | 49 (1.170) | intergenic (‑66/‑217) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide | |||||
CGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAA > W3110S.gb/2091846‑2091984 | cGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAg > 1:1371211/1‑71 (MQ=255) cATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGtt > 1:4108938/1‑71 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:4183030/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:4022486/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3290073/71‑1 (MQ=255) tGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2512690/71‑1 (MQ=255) gTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3557213/70‑1 (MQ=255) gTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2063436/70‑1 (MQ=255) tCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:1072126/70‑1 (MQ=255) tCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:3909986/70‑1 (MQ=255) ctcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc > 1:4484171/1‑70 (MQ=255) tcctcTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGAt > 1:2909916/1‑68 (MQ=255) ctctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc < 1:2811924/67‑1 (MQ=255) tttcgtctcactgacaataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTATTAATTAGttt < 1:2397166‑M1/25‑1 (MQ=255) tttcgtctcactgacaataccttgatctacaaacTAATTAACTATTTATTAATTAGttt < 1:2391838‑M1/25‑1 (MQ=255) ctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa > 1:2397693/1‑71 (MQ=255) ctTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa > 1:4342119/1‑71 (MQ=255) ttttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:4313369/1‑71 (MQ=255) ttttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:3376480/1‑71 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTa < 1:439989/68‑1 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAtt < 1:2220375/70‑1 (MQ=255) ttGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt < 1:3851572/69‑1 (MQ=255) gTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGt < 1:2635398/70‑1 (MQ=255) tACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAg < 1:3992087/62‑1 (MQ=255) cAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGt < 1:3525664/71‑1 (MQ=255) cAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGt < 1:3520563/71‑1 (MQ=255) gTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTga < 1:4099537/71‑1 (MQ=255) ttCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTc < 1:1256072/65‑1 (MQ=255) tCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTa > 1:850153/1‑49 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:3413275/1‑71 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:1220068/1‑71 (MQ=255) cATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGAc > 1:3354840/1‑71 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGt < 1:1977814/55‑1 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGt < 1:1577478/55‑1 (MQ=255) ttGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGa < 1:1499647/71‑1 (MQ=255) tGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:1427295/43‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:3724754/42‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTg < 1:2234176/42‑1 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCa > 1:726317/1‑60 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTgaga > 1:3065239/1‑66 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaa > 1:208078/1‑70 (MQ=255) gTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaa > 1:4540229/1‑70 (MQ=255) tACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaaa > 1:1861210/1‑71 (MQ=255) aCAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAt > 1:2145137/1‑53 (MQ=255) cAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATc < 1:3493881/71‑1 (MQ=255) cAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATc < 1:1112752/71‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAAt > 1:4221247/1‑69 (MQ=255) aaTGATGAGCGTTAATTAACTATTGATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATcc < 1:3569728/71‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATc < 1:1204190/42‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAg < 1:2940979/71‑1 (MQ=255) tgatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAg < 1:1721452/71‑1 (MQ=255) gatgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCa > 1:3764142/1‑53 (MQ=255) atgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGt < 1:1416862/35‑1 (MQ=255) atgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTAtt > 1:2103140/1‑48 (MQ=255) tgaGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCt < 1:2665617/71‑1 (MQ=255) aGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCtt < 1:2527102/70‑1 (MQ=255) aGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTc > 1:4122886/1‑71 (MQ=255) gCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCg > 1:1550875/1‑71 (MQ=255) aaactaattaataaatagttaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaa < 1:2397166‑M2/34‑1 (MQ=255) aaactaattaataaatagttaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaa < 1:2391838‑M2/34‑1 (MQ=255) cGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCg > 1:3266232/1‑70 (MQ=255) ttaattaaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAgg < 1:2297400/37‑1 (MQ=255) taattaataaatagttaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGt < 1:260090‑M2/25‑1 (MQ=255) TAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAt < 1:484564‑M1/71‑1 (MQ=255) AATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCa < 1:3721089‑M1/43‑1 (MQ=255) attaataaatagttaattaGTTTGTAGATCAAGGTAtt > 1:1549355‑M2/20‑38 (MQ=255) ATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAttt > 1:1310682‑M1/1‑71 (MQ=255) ATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAtt > 1:1512084‑M1/1‑70 (MQ=255) TTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAtttt > 1:312043‑M1/1‑71 (MQ=255) TTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAtttt > 1:533077‑M1/1‑71 (MQ=255) TAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTc > 1:2675948‑M1/1‑39 (MQ=255) TAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTc > 1:4023253‑M1/1‑39 (MQ=255) TAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAgg < 1:3433633‑M1/58‑1 (MQ=255) TAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAttttt < 1:4480427‑M1/71‑1 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTg < 1:1920672‑M1/42‑1 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaaa < 1:2221145‑M1/51‑1 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGaaa < 1:3607686‑M1/50‑1 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTc < 1:1268696‑M1/61‑1 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAttttt > 1:1088330‑M1/1‑70 (MQ=255) AACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAttttt > 1:1466662‑M1/1‑70 (MQ=255) ACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTgg > 1:2995421‑M1/1‑71 (MQ=255) ACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTg > 1:3283983‑M1/1‑70 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAtt > 1:1031692/1‑64 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTg < 1:2604664/68‑1 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGc > 1:853126/1‑71 (MQ=255) tttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATcc < 1:861856/49‑1 (MQ=255) ttattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTAt < 1:1181862/60‑1 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTgaga > 1:3851535/1‑38 (MQ=255) attaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCAt < 1:2953372/70‑1 (MQ=255) ttaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATc < 1:2064406‑M2/63‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTaa < 1:3988687‑M2/69‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTaa < 1:2788922‑M2/69‑1 (MQ=255) | CGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAA > W3110S.gb/2091846‑2091984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |