| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2401919 | 50 (1.030) | 8 (0.200) +GGCATTTCA |
3/82 | NT | 14.5% | coding (194/978 nt) | nuoH | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit H |
| ? | W3110S.gb | = 2562879 | 65 (1.330) | coding (1247/1362 nt) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase, large subunit, heavy chain | |||||
TTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCC > W3110S.gb/2562810‑2562949 | tttGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACg > 1:4280750/1‑71 (MQ=255) gCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGca > 1:1475203/1‑70 (MQ=255) gCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGca > 1:2649487/1‑70 (MQ=255) ccATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcac < 1:64242/70‑1 (MQ=255) ccATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcac < 1:3835838/70‑1 (MQ=255) ccATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcac < 1:2648058/70‑1 (MQ=255) tAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTg > 1:1648346/1‑71 (MQ=255) aTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTgg < 1:3397909/70‑1 (MQ=255) aTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGc > 1:2945813/1‑71 (MQ=255) cccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCgg > 1:4020997/1‑70 (MQ=255) cATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTAt > 1:583240/1‑71 (MQ=255) cATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTAt > 1:1490961/1‑71 (MQ=255) aTGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATc > 1:154248/1‑71 (MQ=255) tGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCg < 1:2230473/71‑1 (MQ=255) gCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCAAAGTGGCGGTATCGt > 1:3472056/1‑71 (MQ=255) gCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGAGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGt > 1:995356/1‑71 (MQ=255) cTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGt < 1:1706511/70‑1 (MQ=255) cTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGt < 1:1711890/70‑1 (MQ=255) cTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTg > 1:2459047/1‑71 (MQ=255) tCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTgg < 1:2742738/69‑1 (MQ=255) cagccagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATg < 1:3338004/71‑1 (MQ=255) gccagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCg < 1:2993416/71‑1 (MQ=255) ccagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCgg > 1:2576159/1‑71 (MQ=255) cGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCggtggt < 1:737029/71‑1 (MQ=255) ttCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATc < 1:3149447/54‑1 (MQ=255) cAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTgg > 1:3802741/1‑71 (MQ=255) aaaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTgg < 1:3777341/55‑1 (MQ=255) aaaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTgg > 1:3393167/1‑70 (MQ=255) cTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt < 1:4460024/71‑1 (MQ=255) ccGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:219496/1‑70 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCgg > 1:598728/1‑56 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:4272248/1‑69 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt < 1:2391558/69‑1 (MQ=255) ggTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAg < 1:2094922/71‑1 (MQ=255) ggTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAg < 1:1008993/71‑1 (MQ=255) ggTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAg < 1:308302/71‑1 (MQ=255) ggTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAg < 1:1588413/71‑1 (MQ=255) tGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCa > 1:3730492/1‑71 (MQ=255) gACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat > 1:409006/1‑71 (MQ=255) gACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat > 1:3927735/1‑71 (MQ=255) aCGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGaa > 1:2991464/1‑46 (MQ=255) aCGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat < 1:800237/70‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatga < 1:1006586/71‑1 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGt > 1:4291567/1‑40 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTgg < 1:3947670/42‑1 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTgg < 1:1291198/42‑1 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgat > 1:1031470/1‑71 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgat < 1:525368/71‑1 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgat > 1:425556/1‑71 (MQ=255) ggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgatg < 1:2260847/71‑1 (MQ=255) gcgcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGt < 1:1436982/71‑1 (MQ=255) gcgcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGt > 1:4467217/1‑71 (MQ=255) gcgcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGt < 1:1708868/71‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTa > 1:2350972/1‑55 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAg < 1:1287931/56‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAg < 1:1070872/56‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtca < 1:1266003/71‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtca < 1:3411206/71‑1 (MQ=255) cAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat < 1:3481292/71‑1 (MQ=255) cAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat > 1:2756569/1‑71 (MQ=255) gTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCg < 1:2342621/40‑1 (MQ=255) gTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCt < 1:3005339/47‑1 (MQ=255) gTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCa < 1:943367/59‑1 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta > 1:3921216‑M2/2‑14 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttt > 1:1193120‑M2/2‑14 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt > 1:3643587‑M2/2‑14 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac > 1:2924440‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:250070‑M2/37‑25 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttt > 1:289253‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTa < 1:3555113/50‑1 (MQ=255) ttGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTAATCAcc < 1:4530803/71‑1 (MQ=255) tGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:3664334‑M2/36‑25 (MQ=255) tGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt > 1:1359716/1‑51 (MQ=255) tGACTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTc > 1:2556501/1‑44 (MQ=255) gAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac < 1:3060155‑M2/36‑26 (MQ=255) gAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:335979/1‑51 (MQ=255) aGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAg < 1:2384402/71‑1 (MQ=255) tAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCg > 1:632417/1‑71 (MQ=255) aCTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCgg > 1:215087/1‑70 (MQ=255) cTGACGCACAGTGGGGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt < 1:1091836/44‑1 (MQ=255) cTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCa < 1:2058480/71‑1 (MQ=255) tGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt < 1:1705150/43‑1 (MQ=255) tGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCAt > 1:323449/1‑71 (MQ=255) gACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATc > 1:2048565/1‑71 (MQ=255) aCGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATcc < 1:1191115/71‑1 (MQ=255) aCGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATAACCCAGCGGCATcc > 1:3675723/1‑71 (MQ=255) cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATccc < 1:3268851/71‑1 (MQ=255) cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATccc < 1:790728/71‑1 (MQ=255) | TTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCCC > W3110S.gb/2562810‑2562949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |