| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 3569741 = | 77 (1.580) | 4 (0.090) | 3/88 | NT | 6.2% | coding (276/1407 nt) | yihP | predicted transporter |
| ? | W3110S.gb | 3569763 = | 53 (1.240) | coding (298/1407 nt) | yihP | predicted transporter | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATATGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGTC > W3110S.gb/3569695‑3569831 | atatGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt < 1:3937088/71‑1 (MQ=255)atatGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt > 1:1426430/1‑71 (MQ=255)atatGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAt > 1:354048/1‑70 (MQ=255) tatGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt < 1:2561869/70‑1 (MQ=255) tatGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAt < 1:216475/69‑1 (MQ=255) tGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:2925636/71‑1 (MQ=255) ccGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTa > 1:1890881/1‑67 (MQ=255) cGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGt < 1:1556478/71‑1 (MQ=255) ggCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:886156/63‑1 (MQ=255) aTTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGt > 1:82440/1‑61 (MQ=255) ttATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt < 1:3675612/56‑1 (MQ=255) ttATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTc < 1:4457136/57‑1 (MQ=255) ttATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:3771313/59‑1 (MQ=255) ttATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:828981/59‑1 (MQ=255) aTGTTGGATTCCCGACGTAAGATCGGTCAAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTccc > 1:624642/1‑71 (MQ=255) aTGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCt > 1:2191339/1‑56 (MQ=255) aTGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGt > 1:3310511/1‑58 (MQ=255) aTGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTa > 1:913248/1‑59 (MQ=255) aTGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTcc < 1:1749699/70‑1 (MQ=255) tGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt < 1:939550/53‑1 (MQ=255) tGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTa > 1:2173212/1‑58 (MQ=255) tGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGc > 1:743267/1‑61 (MQ=255) tGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGt > 1:4181894/1‑70 (MQ=255) gATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTa < 1:3354528/46‑1 (MQ=255) aTTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTccc < 1:49486/64‑1 (MQ=255) ttCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTc < 1:3811277/61‑1 (MQ=255) ttCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCt < 1:3941419/71‑1 (MQ=255) ttCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCt < 1:4345256/71‑1 (MQ=255) ttCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCt < 1:2790504/71‑1 (MQ=255) ttCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTGTTATTCTGTATGCGt > 1:4323493/1‑56 (MQ=255) ccGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTAtt < 1:605780/43‑1 (MQ=255) ccGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:490296/46‑1 (MQ=255) ccGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTat < 1:3316087/71‑2 (MQ=255) ccGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTAc > 1:2615644/1‑71 (MQ=255) cGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTccc < 1:1947985/59‑1 (MQ=255) aCGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTgg > 1:2266539/1‑71 (MQ=255) aCGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTg > 1:2709860/1‑70 (MQ=255) cGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGc > 1:766762/1‑71 (MQ=255) gCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTa > 1:3115516/1‑36 (MQ=255) gCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTg < 1:241214/41‑1 (MQ=255) gCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCg < 1:2620281/71‑1 (MQ=255) gCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCg < 1:1273694/71‑1 (MQ=255) cAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGa < 1:2606594/71‑1 (MQ=255) aaGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGt < 1:1461617/56‑1 (MQ=255) aaGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGAt > 1:4269764/1‑71 (MQ=255) aGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCt > 1:2326764/1‑37 (MQ=255) aGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGt < 1:495811/45‑1 (MQ=255) aGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGa < 1:2477352/69‑1 (MQ=255) aTCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTa > 1:146025/1‑38 (MQ=255) aTCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACt < 1:2007249/62‑1 (MQ=255) aTCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGc > 1:766709/1‑71 (MQ=255) tCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGAt < 1:569390/67‑1 (MQ=255) ggTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCg > 1:1134780/1‑48 (MQ=255) gTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTc < 1:3429307/44‑1 (MQ=255) gTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTc < 1:1499173/44‑1 (MQ=255) gTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAAc < 1:50991/71‑1 (MQ=255) gTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTAAGCGTCATTcc > 1:4079416/1‑45 (MQ=255) gTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTATGTATGCGTCATTcc > 1:1141476/1‑45 (MQ=255) tCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTcc > 1:4212254/1‑44 (MQ=255) cAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACttt > 1:3929819/1‑71 (MQ=255) cAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACttt > 1:529032/1‑71 (MQ=255) AAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTcc > 1:1615‑M1/1‑41 (MQ=255) AAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGa > 1:1362880‑M1/1‑59 (MQ=255) AAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGa > 1:1694347‑M1/1‑59 (MQ=255) AAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTg < 1:1228649‑M1/71‑1 (MQ=255) AAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTg > 1:3525336‑M1/1‑71 (MQ=255) aaaggacggaacttaccttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGt < 1:1266532‑M2/50‑1 (MQ=255) AAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGa < 1:808663‑M1/58‑1 (MQ=255) AAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATc < 1:1215981‑M1/60‑1 (MQ=255) AAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATc < 1:3302661‑M1/60‑1 (MQ=255) aaggacggaacttaccttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGcc < 1:4209855‑M2/42‑1 (MQ=255) aaggacggaacttaccttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGt < 1:876852‑M2/50‑1 (MQ=255) AAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTc < 1:4453998‑M1/71‑1 (MQ=255) AAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTc < 1:862739‑M1/71‑1 (MQ=255) AGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCg > 1:3897170‑M1/1‑71 (MQ=255) ggacggaacttaccttttATTCTGTATGCGTCATTACCGGTCACCTTACTgg > 1:3036969‑M2/19‑52 (MQ=255) GGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCgg > 1:4249625‑M1/1‑71 (MQ=255) aGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGcaca > 1:719701/1‑71 (MQ=255) aGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGcac < 1:1571827/70‑1 (MQ=255) gTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCacac > 1:3433348/1‑71 (MQ=255) ttCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGca < 1:3568759/67‑1 (MQ=255) ttCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGca < 1:456714/67‑1 (MQ=255) tCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCCCCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCacac > 1:1392728/1‑69 (MQ=255) ccGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGAt > 1:3343502/1‑48 (MQ=255) cGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGt < 1:40483/70‑1 (MQ=255) gTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGttt < 1:4261432/71‑1 (MQ=255) tCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCg < 1:3545099/43‑1 (MQ=255) tCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTg < 1:4349857/71‑1 (MQ=255) ccttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTc > 1:4347788‑M2/7‑57 (MQ=255) cttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCgg < 1:4439267‑M2/53‑1 (MQ=255) ttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACttt < 1:92058‑M2/48‑1 (MQ=255) ttttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGttt < 1:2317900‑M2/63‑1 (MQ=255) tttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCa < 1:2920270‑M2/43‑1 (MQ=255) tttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGca > 1:1780829‑M2/4‑58 (MQ=255) tttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGt > 1:2387223‑M2/4‑71 (MQ=255) ttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGt > 1:1746024‑M2/3‑70 (MQ=255) ttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGt < 1:1902958‑M2/68‑1 (MQ=255) ttATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGt > 1:2355882‑M2/3‑70 (MQ=255) tATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGTc < 1:1786637‑M2/69‑1 (MQ=255) tATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGTc < 1:4256305‑M2/69‑1 (MQ=255) | ATATGGGTACCGGCATTATGTTGGATTCCCGACGCAAGATCGGTCCAAAAGGTAAGTTCCGTCCTTTTATTCTGTATGCGTCATTCCCGGTCACCTTACTGGCGATCGCCAACTTTGTCGGCACACCGTTTGATGTC > W3110S.gb/3569695‑3569831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |