| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 713954 | 87 (1.490) | 87 (1.490) | 21/100 | NT | 47.2% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | 2809398 = | 108 (1.850) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > W3110S.gb/2809329‑2809467 | tatataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg > 1:243325/1‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:4116934‑M2/70‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:247727‑M2/70‑71 (MQ=255) ataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCt > 1:5297665/1‑71 (MQ=255) ataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCt > 1:4344215/1‑71 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:2030486‑M2/7‑1 (MQ=255) cacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa > 1:3599210‑M2/64‑70 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:1142377/70‑1 (MQ=255) ccACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:3643831/68‑1 (MQ=255) catcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:4743646‑M2/10‑1 (MQ=255) catcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:1814160‑M2/10‑1 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAt > 1:3552083/1‑70 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAt > 1:1879710/1‑70 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1411653‑M2/11‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1506‑M2/11‑1 (MQ=255) tcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:3711273‑M2/11‑1 (MQ=255) tcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa < 1:1200561‑M2/12‑1 (MQ=255) tcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa < 1:3568456‑M2/12‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:976728‑M2/14‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:4698743‑M2/14‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttccggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:5016523‑M2/14‑1 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTa > 1:3410948/1‑69 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt < 1:1184399/71‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:4924824‑M2/14‑1 (MQ=255) aGATTCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:1335347/71‑1 (MQ=255) aGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:669054/71‑1 (MQ=255) aGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:2579982/71‑1 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:4507257/58‑1 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:940975/58‑1 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGaaa > 1:4612636/1‑58 (MQ=255) tttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg > 1:3448188/1‑64 (MQ=255) tgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:2945645‑M2/48‑71 (MQ=255) tgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:3147038‑M2/48‑71 (MQ=255) tgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:950730‑M2/48‑71 (MQ=255) tgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:5403840‑M2/48‑71 (MQ=255) tCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:2227908/1‑70 (MQ=255) tCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:1707751/1‑70 (MQ=255) caattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:5187528‑M2/46‑70 (MQ=255) cTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:2240760/55‑1 (MQ=255) aaaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:5079537/1‑65 (MQ=255) aaaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:34933/68‑1 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:306512/71‑1 (MQ=255) cAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:1970583/71‑1 (MQ=255) gcggaatttattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:3769413‑M2/10‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:2539798‑M2/38‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:1577214‑M2/38‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:3036176‑M2/38‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:1560924‑M2/38‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:2873506‑M2/38‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:4271644‑M2/38‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:4635085/47‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:4320320/47‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:833667/47‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGGCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:863267/47‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:5050519/46‑1 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:4574786‑M2/32‑71 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:5562989‑M2/32‑71 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:390139‑M2/32‑71 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:338482‑M2/32‑71 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGaaa > 1:1275226‑M2/31‑39 (MQ=255) ttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:3952346/41‑1 (MQ=255) ttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:2748173/41‑1 (MQ=255) ttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg > 1:4471107/1‑47 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:3622155/1‑71 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:4655462/1‑71 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:5522612/1‑71 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:3462466‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2718856‑M2/42‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4187379/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2141753/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:3240351/70‑1 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4396834‑M2/42‑1 (MQ=255) aCTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAccc < 1:1741645/42‑1 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:4286366‑M2/16‑59 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:2253016‑M2/16‑59 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1643858‑M2/16‑59 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:5444717‑M2/16‑59 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:5435180‑M2/16‑59 (MQ=255) tCGTTACTATATAGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:4800640/1‑41 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:2862637‑M2/31‑1 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt > 1:773290/1‑70 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt > 1:748271/1‑70 (MQ=255) tataTCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc < 1:592987/54‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:1733488/71‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:3961054/71‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCAAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt > 1:4674090/1‑54 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:4444627‑M2/32‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:5600680‑M2/32‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:4863339‑M2/32‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:1245343‑M2/4‑36 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAAt > 1:382122‑M2/4‑63 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAAt > 1:4049757‑M2/4‑63 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4692732/44‑1 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:3274423/44‑1 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4790197/44‑1 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2365907/44‑1 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1819764/44‑1 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt > 1:3193586/1‑71 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt > 1:1024897/1‑71 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt > 1:4963007/1‑71 (MQ=255) | TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > W3110S.gb/2809329‑2809467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |