Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2541482	2543794	2313	69 [0]	[1] 235	[rfaZ]–[rfaL]	[rfaZ],rfaK,[rfaL]

TGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACT  >  minE/2541422‑2541481                                                            | tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:628221/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:800149/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:785992/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:751834/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:723789/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:702014/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:685257/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:650864/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:644114/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:804831/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:623651/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:577526/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:574235/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:557319/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:54402/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:531026/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:521927/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:512422/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:854580/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:968087/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:949268/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:921555/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:909413/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:90612/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:898834/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:878495/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:855893/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:492478/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:850772/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:843741/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:83947/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:821289/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:817545/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:811458/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:809665/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:113332/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:205755/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:204053/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:198854/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:197765/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:138743/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:136685/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:117408/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1136384/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:208701/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1131882/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1131381/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1118683/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:110162/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1081612/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1069503/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1030200/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:363837/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:480663/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:463280/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:449097/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:447077/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:438932/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:409847/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:394280/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:376051/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:1009398/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:330701/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:311833/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:304849/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:292171/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:242291/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:23985/1‑60 (MQ=255) tGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACt  >  1:211217/1‑60 (MQ=255)                                                            | TGTCAATGGTTCTGCGCAATATCTGTTAAGTAATAATATCGTTCCTTTTATATATGTACT  >  minE/2541422‑2541481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑