Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2541482 2543794 2313 69 [0] [1] 235 [rfaZ]–[rfaL] [rfaZ],rfaK,[rfaL]

Only 100 of 235 total aligned reads displayed.

AGTAGAACAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTATT  >  minE/2543788‑2543841
       |                                              
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTataata         >  1:10323/1‑40 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTataat          >  1:300481/1‑39 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTGTAATAAGCTAtt  >  1:1113305/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:573099/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:702736/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:693546/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:687626/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:684769/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:649448/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:648800/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:64248/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:633323/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:626074/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:615360/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:613526/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:600073/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:726735/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:566104/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:553292/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:549802/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:548776/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:546102/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:535825/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:529941/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:523891/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:513976/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:503057/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:84326/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:969446/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:956768/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:946881/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:94096/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:93505/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:92818/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:913164/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:907185/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:877264/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:875003/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:873259/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:845702/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:714754/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:82954/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:822119/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:811786/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:797567/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:780572/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:776467/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:762818/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:751597/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:746291/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:733047/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:452335/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1129010/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:212944/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:19667/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:190058/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:178538/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:166696/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:157211/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:147689/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:133281/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1142054/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1140483/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1136915/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:230693/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1119484/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1100478/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1092215/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1085031/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1075866/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1063125/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:106061/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1043361/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1035257/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:102643/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1020850/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:256101/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:1001668/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:450866/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:44682/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:434644/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:422762/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:414665/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:410560/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:407036/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:386744/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:380633/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:374833/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:364713/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:362802/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:35702/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:354201/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:342796/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:323968/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:299205/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:281660/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:264113/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtt  >  1:473814/1‑47 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAtc  >  1:348206/1‑46 (MQ=255)
       cAATAGAGGAAGTGAATATCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTAt   >  1:369587/1‑46 (MQ=255)
       |                                              
AGTAGAACAATAGAGGAAGTGAATTTCTTGGGTGATTTATTATAATAAGCTATT  >  minE/2543788‑2543841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑