Missing coverage evidence...
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TTAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGT  >  minE/313184‑313244                                                             | ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:108853/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1218981/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1219825/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1393579/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1794337/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:375249/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:433384/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:679437/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:705137/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:728690/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:852498/61‑1 (MQ=255) ttAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:939943/61‑1 (MQ=255)  tAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1101357/60‑1 (MQ=255)   aaGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGt  <  1:1439246/59‑1 (MQ=255)                                                             | TTAAGCCCTTCTTCCAGACGTGCGCGCACGAACATACCCGGCAGCAGAGTGTGATCCGGGT  >  minE/313184‑313244

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑