Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 313245 313279 35 14 [0] [0] 102 acrA multidrug efflux system

Only 100 of 102 total aligned reads displayed.

GTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTC  >  minE/313280‑313341
|                                                             
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCGAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1025544/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCTGGAACTTAATGCCGTc  <  1:489076/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:437872/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:647390/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:634933/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:630637/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:597882/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:563686/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:546372/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:52737/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:526394/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:520644/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:490929/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:43978/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:658667/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:424446/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:421034/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:397694/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:389478/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:340494/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:340057/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:33034/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:313334/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:301471/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:276702/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:268514/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:850335/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:971765/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:970333/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:962108/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:937505/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:932543/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:924657/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:918861/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:912859/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:900146/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:893130/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:882765/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:882427/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:656277/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:83552/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:822280/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:819454/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:816571/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:814790/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:813544/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:795761/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:772489/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:716229/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:7151/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:252950/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1199422/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1469058/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1436333/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1429739/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1421979/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1414091/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1392644/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1386292/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1363104/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1294524/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1228327/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1223786/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:14735/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1167595/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1165739/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1137717/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1128246/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1109017/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1108522/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1087977/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1058063/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:104197/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1025927/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1023946/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1707042/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:23682/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1889272/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1887865/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1860316/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1854251/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1846915/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1831072/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1824182/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1806990/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1803243/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1795062/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1022821/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1699294/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1678485/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1666487/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1661387/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1635097/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1630779/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1622822/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1578786/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1558485/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1539887/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGGCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1839214/62‑1 (MQ=255)
gTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGAACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTc  <  1:1357195/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
GTCTGATCAACGGTAACGTCAGAGAATTCCAGCGTACCGTCCTGCGGGAACTTAATGCCGTC  >  minE/313280‑313341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑