Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1261259 1261659 401 100 [0] [0] 145 torY TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

CGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCT  >  minE/1261197‑1261258
                                                             |
cGCCTGACTCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:650289/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCCTTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1716050/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCTGTATTCGGCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:109311/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCCGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:705861/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGCGCGCCt  <  1:1197736/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:556884/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:24231/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:544003/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:518191/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:498328/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:477768/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:444551/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:418097/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:397899/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:378917/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:363330/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:358839/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:344087/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:334316/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:318238/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:31751/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:315202/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:31477/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:287802/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:251173/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:249398/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:987089/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:760191/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1030222/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:965544/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:964567/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:919669/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:914712/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:908858/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:904542/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:899275/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:877283/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:79560/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:775248/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:570657/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:745031/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:726042/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:688496/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:672261/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:637868/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:615257/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:606441/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:598964/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:575980/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:571812/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:132161/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1519648/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:23891/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1426020/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1413048/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1384696/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1363275/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1352431/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1338857/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1337440/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1336647/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1326897/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1478002/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:130231/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1298109/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1270861/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1265802/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1262077/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1253455/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1202455/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1194222/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1182408/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1150197/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1130323/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1737317/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:233722/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:217236/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:211838/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1874269/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1861382/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1774651/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1751468/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1745912/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1727571/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1682858/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1667082/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1662118/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1627006/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1616459/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1612593/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1601945/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGGTTACAGTGAGCGCCt  <  1:316079/62‑1 (MQ=255)
cGCCTGACGCCACTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1232880/62‑1 (MQ=255)
 gCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:679201/61‑1 (MQ=255)
 gCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1519653/61‑1 (MQ=255)
 gCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1739467/61‑1 (MQ=255)
     gACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACATTGAGCGCCt  <  1:1176715/57‑1 (MQ=255)
                  gCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:1548553/44‑1 (MQ=255)
                      tATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCt  <  1:450165/40‑1 (MQ=255)
                           gTCAGACTGCCATTCCCCGTTTAAAGTGAGCGCCt  <  1:1539280/35‑1 (MQ=38)
                                                             |
CGCCTGACGCCATTGATTGCCGTATTCGTCAGCCTGCCATTCCCCGTTTACAGTGAGCGCCT  >  minE/1261197‑1261258

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: