Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1261259 1261659 401 100 [0] [0] 145 torY TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

Only 100 of 145 total aligned reads displayed.

CGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCG  >  minE/1261660‑1261707
|                                               
cGGCACGTTGGAGAGTAAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:683227/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTTGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1329516/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTcc             >  1:143220/1‑37 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCTTACTGTTTCg  >  1:1375787/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATa          >  1:660267/1‑40 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTc   >  1:1130636/1‑47 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTc   >  1:118461/1‑47 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTc   >  1:736692/1‑47 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTc   >  1:937635/1‑47 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:503217/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:540600/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:503928/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:508194/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:498874/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:51770/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:497028/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:521577/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1839235/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:478366/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:476286/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:459670/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:438376/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:433406/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:393600/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:302778/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:289365/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:224043/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1881780/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1878932/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1872254/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1020350/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:687281/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:887359/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:874176/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:85613/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:840708/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:80884/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:777837/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:761966/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:722676/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:700076/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:691665/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:547415/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:660836/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:647791/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:643478/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:63622/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:62771/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:619263/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:610941/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:586344/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:576868/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1175166/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1414864/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1399986/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1382714/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1368525/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1347321/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:128157/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1269800/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1264712/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1258867/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1230413/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:120651/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1832138/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1165396/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1141135/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:112730/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1123057/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1086105/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1079720/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1077127/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1069194/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1022044/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1010073/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1463008/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1837432/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1830887/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1823397/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1789634/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1761243/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1761198/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1708633/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:169842/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1648661/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1646341/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1637443/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1615715/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1611645/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1603326/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1597142/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1590879/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1587206/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1562963/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:150313/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1472495/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1465781/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCg  >  1:1433751/1‑48 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGATTct  >  1:97370/1‑47 (MQ=255)
cGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATACTTTCCATACTGTTTCg  >  1:643903/1‑48 (MQ=255)
|                                               
CGGCACGTTGCAGAGTCAGTGGCTTTTAATTCTTTCCATACTGTTTCG  >  minE/1261660‑1261707

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: