Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2542578	2542607	30	28 [0]	[0] 50	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

ATGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAA  >  minE/2542538‑2542577                                        | aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:171645/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:988810/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:930275/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:89510/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:86401/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:648310/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:643325/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:376840/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:344940/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:310685/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:300832/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1843592/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1812100/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1731828/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:101164/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1666586/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:165411/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1652509/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1588248/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1565706/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1465127/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1455807/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1264339/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1261374/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1190044/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:109780/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1065706/1‑40 (MQ=255) aTGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTaa  >  1:1044073/1‑40 (MQ=255)                                        | ATGCCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAA  >  minE/2542538‑2542577

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑