Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2542578	2542607	30	28 [0]	[0] 50	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

GGTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTAA  >  minE/2542608‑2542655 |                                                ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCATGATGAATGTTTaa  <  1:823683/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:689073/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:218590/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:240372/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:305721/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:311468/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:359282/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:386756/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:41277/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:442119/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:479251/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:53401/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:548509/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:638644/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1883471/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:721860/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:730610/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:758492/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:77168/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:813989/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:821868/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:857011/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:870738/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:871562/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:953226/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1355591/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:103829/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1045257/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1065661/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1076228/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1111567/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1125047/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1143670/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:118296/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1224303/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1231897/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1241347/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:134188/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:100580/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1362104/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1419440/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1512759/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1519132/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1539643/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1626846/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:165807/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1741931/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1745626/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1769948/48‑1 (MQ=255) ggTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTaa  <  1:1835604/48‑1 (MQ=255) |                                                GGTATAAGCGTTACTATTCATTTTACCATCCCCACGATGAATGTTTAA  >  minE/2542608‑2542655

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑