Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1839750	1840305	556	35 [0]	[0] 77	[surE]–[truD]	[surE],[truD]

CGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATC  >  minE/1840306‑1840355 |                                                  cGTCAACAACTTGATTAACGTGTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:125966/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:382430/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:553879/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:528720/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:484109/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:467392/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:424424/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:392777/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:388125/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:384925/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:583396/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:317317/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:311380/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:287679/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:260678/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:223130/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:217501/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:203341/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1831535/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1800815/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:825624/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:962249/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:946570/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:945915/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:924867/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:908342/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:888527/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:886993/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:867870/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:860877/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:567259/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:766483/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:727879/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:724855/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:719671/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:640590/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:63401/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:601112/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1798694/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1107422/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1344112/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1309782/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:124679/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1241675/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1148721/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1123694/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1122597/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1119321/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1111272/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1399719/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1088106/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1068921/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1060247/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1057646/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1055526/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1025821/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1016198/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1007437/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1623747/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1767130/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1763472/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1756671/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1718884/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1669156/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1657625/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1655953/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1632714/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1000534/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1614082/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1585245/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1576367/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1564998/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1544602/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1503117/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1455692/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATc  <  1:1447034/50‑1 (MQ=255) cGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGAAACAATc  <  1:330479/50‑1 (MQ=255) |                                                  CGTCAACAACTTGATTAACGTCTGCTTTTTTGAGGCGCTCAGCAACAATC  >  minE/1840306‑1840355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑