Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539454	2539499	46	69 [0]	[0] 13	[rfaJ]	[rfaJ]

ATAGATAAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTAAA  >  minE/2539500‑2539561 |                                                              atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATGTAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1698465/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1050655/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1240181/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1285625/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1323615/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1522200/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:1625372/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:339763/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:373976/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:518134/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:612278/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:726329/62‑1 (MQ=255) atagataAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTaaa  <  1:782507/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATAGATAAAGTTAAAGCCTGGGATTTTCGGCTAGCTAATATAAATACTTCTGAATGTTTAAA  >  minE/2539500‑2539561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑