| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 443782 = | 83 (1.020) | 9 (0.170) | 3/62 | NT | 20.3% | intergenic (‑43/‑125) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein |
| ? | AP009048 | 443830 = | 18 (0.350) | intergenic (‑91/‑77) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein | |||||
CAAAGTTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/443864‑443782‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAG > AP009048/443830‑443898 CAAAGTTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC < 1:7594354/71‑1CAAAGTTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCA > 1:71289/1‑70 AAAGTTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:184730/1‑70 TTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTA < 1:2505518/71‑1 TTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCA < 1:6590292/65‑1 TTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCA < 1:5548389/65‑1 AAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAG > 1:3429975/1‑71 AAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAG > 1:3631982/1‑71 ATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAG > 1:5724530/1‑69 ATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC < 1:1983389/62‑1 ATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC < 1:795835/62‑1 TAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCA > 1:2697862/1‑60 ACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGAT < 1:2445223/70‑1 ACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGAT < 1:4340066/70‑1 ACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCA > 1:3916740/1‑54 CGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTA < 1:1618323/62‑1 ACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTTATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGC < 1:6082447/53‑1 ACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGC < 1:404370/53‑1 ACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGC < 1:896684/53‑1 AGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:2876170/1‑53 AGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:3696015/1‑53 AGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:6754751/1‑53 AGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:6758741/1‑53 AGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCAC > 1:3999506/1‑53 ACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAA > 1:7355397/1‑47 CAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCA < 1:1646866/38‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:7524621/55‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:1294570/55‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:7452841/55‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:3929195/55‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:3437759/55‑1 TGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTG < 1:157526/55‑1 CATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACT > 1:7667113/1‑50 CATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGAC > 1:3831321/1‑49 AGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGA < 1:2176828/45‑1 ATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTT < 1:7499383/46‑1 ATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATT < 1:2766954/45‑1 TGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGC < 1:808872/69‑1 GCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCAT > 1:6710753/1‑70 CACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATT < 1:639797/58‑1 ACAATTAAGGGATACGTCCTGGTTCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTA < 1:4814930/55‑1 ACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGC < 1:469302/61‑1 ACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTA < 1:6850073/55‑1 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAA < 1:4524098/71‑1 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAA < 1:6434555/71‑1 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAA < 1:6425256/71‑1 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCT > 1:4868876/1‑61 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTAT > 1:3575028/1‑58 CAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTAT > 1:7402251/1‑58 ATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTT > 1:5119831/1‑45 ATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTT > 1:1699531/1‑45 ATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTT > 1:941459/1‑45 TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAA > 1:3755368/1‑70 TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAA > 1:7306141/1‑70 TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGC > 1:7888628/1‑57 TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGC > 1:3984331/1‑57 TTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGC > 1:3341495/1‑57 AAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATG < 1:4823212/70‑1 AAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATG < 1:4740899/70‑1 AAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATG > 1:4482479/1‑70 AGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATG < 1:7227987/69‑1 AGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAA > 1:6022653/1‑67 AGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAA > 1:136278/1‑67 GGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCG < 1:6600458/57‑1 GATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGG > 1:867127/1‑70 GATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCA > 1:7514482/1‑57 GATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGC < 1:4838346/56‑1 TACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAG < 1:5307456/71‑1 TACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAG < 1:4737145/71‑1 CAAAGTTAAATAACCGACAGTCCTGCACCAGGACGTATCCCTTAATTGTGCATAGTCGCAACAGCATGCACAATTAAGGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/443864‑443782‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAG > AP009048/443830‑443898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |