| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 443782 = | 83 (1.020) | 9 (0.170) | 3/62 | NT | 20.3% | intergenic (‑43/‑125) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein |
| ? | AP009048 | 443830 = | 18 (0.350) | intergenic (‑91/‑77) | panE/yajQ | 2‑dehydropantoate reductase, NADPH‑specific/predicted nucleotide binding protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAG > AP009048/443762‑443900 | cTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACg > 1:7829021/1‑70 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTc < 1:2109895/69‑1 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:4022683/1‑71 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:770159/1‑71 (MQ=255) cGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCt > 1:4710853/1‑71 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa < 1:5982593/71‑1 (MQ=255) aaTAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa > 1:3025440/1‑71 (MQ=255) tAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:2469132/1‑71 (MQ=255) cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCgg > 1:5800638/1‑71 (MQ=255) cTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCgg < 1:5943841/71‑1 (MQ=255) ATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt < 1:2445223‑M1/70‑1 (MQ=255) ATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt < 1:4340066‑M1/70‑1 (MQ=255) CTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt > 1:3429975‑M1/1‑71 (MQ=255) CTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt > 1:3631982‑M1/1‑71 (MQ=255) CTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAt > 1:5724530‑M1/1‑69 (MQ=255) TAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCg < 1:1618323‑M1/62‑1 (MQ=255) TAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa < 1:2505518‑M1/71‑1 (MQ=255) TTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGt > 1:7355397‑M1/1‑47 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:1294570‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:7452841‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:3437759‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:3929195‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:157526‑M2/18‑1 (MQ=255) tgtgcatagtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTg < 1:7524621‑M2/18‑1 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:3696015‑M1/1‑53 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:3999506‑M1/1‑53 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:2876170‑M1/1‑53 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:6758741‑M1/1‑53 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACt > 1:6754751‑M1/1‑53 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAt < 1:795835‑M1/62‑1 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAt < 1:1983389‑M1/62‑1 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACttt > 1:184730‑M1/1‑70 (MQ=255) GTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTg < 1:7594354‑M1/71‑1 (MQ=255) TGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTa > 1:2697862‑M1/1‑60 (MQ=255) TGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa < 1:6590292‑M1/65‑1 (MQ=255) TGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTaa < 1:5548389‑M1/65‑1 (MQ=255) GCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:896684‑M1/53‑1 (MQ=255) GCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:404370‑M1/53‑1 (MQ=255) GCATGCTGTTGCGACTATGCACAATAAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:6082447‑M1/53‑1 (MQ=255) TGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTg < 1:1646866‑M1/38‑1 (MQ=255) TGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGt > 1:3916740‑M1/1‑54 (MQ=255) gCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTTTCg < 1:7234233/51‑1 (MQ=255) agtcgcaacagcatgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGa < 1:2176828‑M2/15‑1 (MQ=255) tGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGa > 1:5589131/1‑43 (MQ=255) tGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt < 1:1222240/56‑1 (MQ=255) ttGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGta > 1:6707327/1‑67 (MQ=255) ttGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGt > 1:783268/1‑66 (MQ=255) tGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAtt < 1:4543426/52‑1 (MQ=255) gCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATg > 1:1301075/1‑70 (MQ=255) cGACTATGCACAATTAAGGGTTACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCt < 1:5663586/71‑1 (MQ=255) cGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt > 1:2991703/1‑51 (MQ=255) cGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGc < 1:5121058/70‑1 (MQ=255) cGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCt < 1:1109153/71‑1 (MQ=255) cGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCt < 1:2523938/71‑1 (MQ=255) gACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCtt < 1:2403286/71‑1 (MQ=255) gACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCtt < 1:7579172/71‑1 (MQ=255) aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg < 1:4797919/35‑1 (MQ=255) aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAgg < 1:7863768/35‑1 (MQ=255) aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACtt < 1:6408119/54‑1 (MQ=255) aCTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCt < 1:2120503/69‑1 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGAc > 1:500284/1‑36 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:797770/39‑1 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:3201962/39‑1 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGt < 1:1304382/39‑1 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTc > 1:4250482/1‑70 (MQ=255) cTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCg > 1:1113205/1‑71 (MQ=255) atgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAttt < 1:7499383‑M2/28‑1 (MQ=255) atgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTAtt < 1:2766954‑M2/27‑1 (MQ=255) tgcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGc < 1:808872‑M2/52‑1 (MQ=255) gcacaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCAt > 1:6710753‑M2/17‑70 (MQ=255) acaattaagggataCGTCCTGGTTCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGta < 1:4814930‑M2/41‑1 (MQ=255) acaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGta < 1:6850073‑M2/41‑1 (MQ=255) acaattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGc < 1:469302‑M2/47‑1 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGtattat > 1:3575028‑M2/14‑58 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGtattat > 1:7402251‑M2/14‑58 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCt > 1:4868876‑M2/14‑61 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaa < 1:6434555‑M2/58‑1 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaa < 1:6425256‑M2/58‑1 (MQ=255) caattaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaa < 1:4524098‑M2/58‑1 (MQ=255) attaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACttt > 1:1699531‑M2/12‑45 (MQ=255) ttaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGc > 1:7888628‑M2/11‑57 (MQ=255) ttaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGc > 1:3341495‑M2/11‑57 (MQ=255) ttaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGc > 1:3984331‑M2/11‑57 (MQ=255) ttaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaaaa > 1:3755368‑M2/11‑70 (MQ=255) ttaagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaaaa > 1:7306141‑M2/11‑70 (MQ=255) aagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATg > 1:4482479‑M2/9‑70 (MQ=255) aagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATg < 1:4740899‑M2/62‑1 (MQ=255) aagggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATg < 1:4823212‑M2/62‑1 (MQ=255) agggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaaaa > 1:6022653‑M2/8‑67 (MQ=255) agggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCaaaaa > 1:136278‑M2/8‑67 (MQ=255) agggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATg < 1:7227987‑M2/62‑1 (MQ=255) gggataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCg < 1:6600458‑M2/51‑1 (MQ=255) gataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGc < 1:4838346‑M2/52‑1 (MQ=255) gataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCa > 1:7514482‑M2/5‑57 (MQ=255) gataCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAgg > 1:867127‑M2/5‑70 (MQ=255) taCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGgag < 1:4737145‑M2/69‑1 (MQ=255) taCGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGgag < 1:5307456‑M2/69‑1 (MQ=255) cGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCgg > 1:5074742/1‑38 (MQ=255) cGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCgg > 1:6575438/1‑38 (MQ=255) cGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGagag > 1:7915211/1‑71 (MQ=255) | CTCCGGGTGTTCAATAAGGCTATCCCTTAATTGTGCATGCTGTTGCGACTATGCACAATTAAGGGATACGTCCTGGTGCAGGACTGTCGGTTATTTAACTTTGCGGGTATTATGCTTCGCATCAAAAATGAAGGGAGAG > AP009048/443762‑443900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |