| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 169029 | 76 (0.930) | 10 (0.140) | 3/84 | NT | 10.4% | coding (1546/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
| ? | AP009048 | = 169050 | 108 (1.550) | coding (1567/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGT > AP009048/168960‑169099 | tctcTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTaa > 1:2861431/1‑71 (MQ=255) tAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTAcc > 1:4095435/1‑71 (MQ=255) tAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTA < 1:4026605‑M1/65‑1 (MQ=255) aaCCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCt > 1:1628836/1‑71 (MQ=255) cgcgTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGtt < 1:3741604/71‑1 (MQ=255) cgcgTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGtt < 1:1576770/71‑1 (MQ=255) gcgTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGttt > 1:2291774/1‑71 (MQ=255) gcgTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGttt > 1:1973790/1‑71 (MQ=255) cgTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGttt > 1:6442758/1‑70 (MQ=255) ccGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGtt > 1:2648671/1‑64 (MQ=255) ccGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATaa < 1:3033930/70‑1 (MQ=255) ccGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATaa < 1:191351/70‑1 (MQ=255) gacgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGgtg > 1:3522477/1‑71 (MQ=255) acgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:888555‑M2/1‑70 (MQ=255) cgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTaa > 1:686181/1‑49 (MQ=255) cgacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGta > 1:4707313‑M2/1‑69 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCTTGGTGGTGTTAACt < 1:4994892/50‑1 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACt < 1:3146733/50‑1 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACt < 1:1127628/50‑1 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACt < 1:1050296/50‑1 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTTCCTGTTTGATAATGGTGt > 1:7820033‑M2/1‑68 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGgt < 1:6317467/67‑1 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa > 1:7854042‑M2/1‑68 (MQ=255) gacCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:2007755‑M2/1‑68 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAcaccattatcaaacaggtagttaaca > 1:1051382‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAcaccattatcaaacaggtagttaaca > 1:6557978‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAcaccattatcaaacaggtagttaaca > 1:1112766‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:322118‑M2/1‑66 (MQ=255) cGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAAt < 1:2944595/61‑1 (MQ=255) cGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacac < 1:388043‑M2/71‑7 (MQ=255) cGATAAACGTGATGAAAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacac < 1:5258550‑M2/71‑7 (MQ=255) gATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTA < 1:7801760‑M1/43‑1 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTaa > 1:5151591/1‑43 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACt > 1:470188/1‑45 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACt > 1:422772/1‑45 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATgg > 1:2167877/1‑61 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt < 1:4735508/71‑1 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:6704889/1‑71 (MQ=255) aTAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt < 1:3867692/71‑1 (MQ=255) tAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:565426/1‑70 (MQ=255) tAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:5409060/1‑70 (MQ=255) tAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCt > 1:700416/1‑70 (MQ=255) aCGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTAc < 1:4556476/43‑1 (MQ=255) gTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATg > 1:7911159/1‑54 (MQ=255) tgatgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTAc < 1:6260056/40‑1 (MQ=255) atgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:7655213/1‑71 (MQ=255) tgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATg > 1:5785184/1‑50 (MQ=255) tgaCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGt > 1:1291933‑M2/1‑53 (MQ=255) aCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAcaccattatcaaacaggtagtta < 1:7604316‑M1/53‑24 (MQ=255) aCAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAcaccattatcaaacaggtagtta < 1:2611779‑M1/53‑24 (MQ=255) aaaCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAg > 1:5972519/1‑71 (MQ=255) aaCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa < 1:5794249‑M2/51‑4 (MQ=255) aCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGc > 1:6933837/1‑70 (MQ=255) aCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGc > 1:2685807/1‑70 (MQ=255) aCAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGc > 1:6876871/1‑70 (MQ=255) tttACCTGGCGTGGTGGTGCTAACTACCTGTTTGATAATGgt < 1:6197403/42‑1 (MQ=255) ttACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa < 1:1936354‑M2/45‑4 (MQ=255) tACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGt > 1:1875669/1‑71 (MQ=255) aCCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGATTCGt < 1:1890802/70‑1 (MQ=255) aCCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGt < 1:4620407/70‑1 (MQ=255) cTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg < 1:6121981/71‑1 (MQ=255) cGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaa > 1:7525182‑M2/1‑34 (MQ=255) cGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAAcc < 1:4154485/71‑1 (MQ=255) tggtggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACctt > 1:6569868/1‑71 (MQ=255) ggtggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACcttc > 1:1766865/1‑71 (MQ=255) tggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAg < 1:308952/45‑1 (MQ=255) tggtgTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCg < 1:1587836/58‑1 (MQ=255) gtgtTAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcg < 1:936605‑M1/71‑66 (MQ=255) gtgtTAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcg < 1:388043‑M1/71‑66 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:2828540/1‑42 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:4468750/1‑42 (MQ=255) gtgtTAACTACCTGTCTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCa > 1:125182/1‑42 (MQ=255) tgtTAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:5034714‑M1/1‑5 (MQ=255) tgtTAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtc < 1:5850043‑M1/57‑53 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg < 1:6700737‑M2/71‑46 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttg < 1:3522683‑M2/55‑30 (MQ=255) tgtTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGc < 1:6014727/71‑1 (MQ=255) ttAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtt < 1:1671801‑M1/51‑49 (MQ=255) ttAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtt < 1:5784663‑M1/51‑49 (MQ=255) ttAcaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacg > 1:6117545‑M1/1‑3 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt < 1:406623/56‑1 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCg > 1:1191342/1‑68 (MQ=255) ttAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCg > 1:4994474/1‑68 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgt < 1:3394196‑M2/53‑31 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgt < 1:6585405‑M2/53‑31 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGtaacaccaccacgccaggtaaactgtttgt < 1:4848360‑M2/53‑31 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCta > 1:5476611/1‑42 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt > 1:2148081/1‑55 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt > 1:5598504/1‑55 (MQ=255) tAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGttt > 1:7038131/1‑55 (MQ=255) tAAATACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAg > 1:42046/1‑71 (MQ=255) acaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgt > 1:2589249‑M1/1‑1 (MQ=255) acaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:3979762‑M1/1‑1 (MQ=255) acaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:322118‑M1/1‑1 (MQ=255) acaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcgg > 1:555583‑M1/1‑1 (MQ=255) acaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaac > 1:1071320‑M1/1‑1 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:3636476/1‑39 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGc > 1:492789/1‑39 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGATTCGTTTGa < 1:1948670/56‑1 (MQ=255) aaCTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTg < 1:7476072/55‑1 (MQ=255) | TCTCTTAACCGCGTTGCCGGGACGACCGATAAACGTGATGACAAACAGTTTACCTGGCGTGGTGGTGTTAACTACCTGTTTGATAATGGTGTAACACCTTACTTCAGCTATAGCGAATCGTTTGAACCTTCTTCGCAAGT > AP009048/168960‑169099 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |