| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 1419105 = | 56 (0.690) | 5 (0.070) | 3/86 | NT | 8.7% | intergenic (‑5/+97) | recE/racC | exonuclease VIII, 5' ‑> 3' specific dsDNA exonuclease/hypothetical protein |
| ? | AP009048 | 1419129 = | 56 (0.780) | intergenic (‑29/+73) | recE/racC | exonuclease VIII, 5' ‑> 3' specific dsDNA exonuclease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GACGACGTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAG > AP009048/1419035‑1419175 | aaatagcctgcgtatggcgcaggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaat < 1:2831413‑M1/1‑1 (MQ=255) aatagcctgcgtatggcgcaggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaatt > 1:1882347‑M1/70‑71 (MQ=255) gacgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGtttttt < 1:3049970/71‑1 (MQ=255) gacgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGtttttt < 1:685709/71‑1 (MQ=255) gacgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGttttt > 1:3018975/1‑70 (MQ=255) acgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTa < 1:3361175/71‑1 (MQ=255) acgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTa < 1:3292607/71‑1 (MQ=255) acgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTa < 1:1234768/71‑1 (MQ=255) cgTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTaa < 1:2861045/71‑1 (MQ=255) cctgcgtatggcgcaggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaat < 1:579651‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTaa > 1:1241404/1‑68 (MQ=255) cAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTaa > 1:6370062/1‑68 (MQ=255) ggTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGtttt > 1:7008587/1‑62 (MQ=255) ggTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGtttt > 1:6006678/1‑62 (MQ=255) ttCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGtttttt < 1:3766570/62‑1 (MQ=255) gcaggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaatttt < 1:6631574‑M1/4‑1 (MQ=255) gatgatTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGAt > 1:1603894/1‑70 (MQ=255) atgatTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGAt > 1:7517134/1‑69 (MQ=255) atgatTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTa < 1:2296851/71‑1 (MQ=255) tgatTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAg > 1:7124280/1‑66 (MQ=255) ggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaattt > 1:3630947‑M1/50‑52 (MQ=255) ggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaattt > 1:6814785‑M1/50‑52 (MQ=255) ggctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaaTTTTAACCTCAACTCAGATTaa > 1:2634548‑M1/50‑71 (MQ=255) gatTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTaa > 1:7386461/1‑70 (MQ=255) ctatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaaTTTTAACCTCAACTCAGATTaaaa < 1:2104090‑M1/24‑1 (MQ=255) atTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAATCTGAGTTGAGGTTaaaa < 1:5510354/71‑1 (MQ=25) ttttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCaa > 1:7358410/1‑58 (MQ=255) tatgaacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaaTTTTaa < 1:1603116‑M1/6‑1 (MQ=255) tttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAAt > 1:6798638/1‑70 (MQ=255) ttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAAtt < 1:3115732/70‑1 (MQ=255) ttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTaa < 1:3227442/64‑1 (MQ=255) aacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaaTTTTa > 1:6686710‑M1/43‑47 (MQ=255) aacagtgtgtatccggcaagatcattcactgaacaaaacgaaTTTTa > 1:2747869‑M1/43‑47 (MQ=255) cGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCaa > 1:5658938/1‑52 (MQ=255) gCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCt < 1:5926938/48‑1 (MQ=255) gCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCt < 1:6593920/48‑1 (MQ=255) gCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCt < 1:1348267/48‑1 (MQ=255) cTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCa < 1:7813102/54‑1 (MQ=255) ttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTaaa > 1:2806939/1‑59 (MQ=255) ttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:1522503/1‑71 (MQ=255) ttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:3622244/1‑71 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGAtt > 1:4570954/1‑55 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGAtt > 1:3290704/1‑55 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:3733647/70‑1 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:1343916/70‑1 (MQ=255) ccGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:4826392/1‑69 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAAc < 1:1150437/40‑1 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGt > 1:535850/1‑62 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:5662807/70‑1 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:797731/70‑1 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:1304/70‑1 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCa < 1:2727772/47‑1 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCa < 1:6422278/47‑1 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:552951/1‑70 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:7074385/1‑70 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTg < 1:7895751/71‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATAAAAATTCGtttt > 1:4873639/1‑62 (MQ=255) ggAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGa > 1:1936511/1‑71 (MQ=255) aaGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGttt > 1:5282926/1‑55 (MQ=255) gagTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:5749554/59‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:5933040/1‑60 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:3073509/1‑60 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCtt < 1:1316535/70‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTg < 1:4579412/71‑1 (MQ=255) tcactgaacaaaacgaaTTTTAACCTCAACTCAGATTaaa < 1:6155337‑M1/23‑1 (MQ=255) tcactgaacaaaacgaaTTTTAACCTCAACTCAGATTaaa < 1:4458882‑M1/23‑1 (MQ=255) tcactgaacaaaacgaaTTTTAACATCAACTCAGATTaaa < 1:3029649‑M1/23‑1 (MQ=255) tgCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATacac < 1:2025253/71‑1 (MQ=255) tgCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATaca < 1:5540801/70‑1 (MQ=255) tgCTCATTGGTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTCCCg < 1:4289300/64‑1 (MQ=255) gCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTc < 1:4345899/46‑1 (MQ=255) cTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:3862137/44‑1 (MQ=255) cTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATacacac < 1:1245126/71‑1 (MQ=255) tCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACt > 1:1818110/1‑71 (MQ=255) aTTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:1117837/1‑38 (MQ=255) 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gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:7396504/38‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:2216080/38‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCt > 1:4069428/1‑51 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt > 1:3616213/1‑69 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:4195131/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:2418613/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:2452000/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCAt < 1:3711894/71‑1 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa > 1:2178596/1‑38 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa > 1:4915653/1‑69 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATg > 1:6441897‑M1/1‑44 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACTCACTGTTCATAg < 1:5640187‑M1/71‑1 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAg < 1:7690508‑M1/71‑1 (MQ=255) | GACGACGTCAGGTTCACCGGATGATTTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAG > AP009048/1419035‑1419175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |