| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 1419105 = | 56 (0.690) | 5 (0.070) | 3/86 | NT | 8.7% | intergenic (‑5/+97) | recE/racC | exonuclease VIII, 5' ‑> 3' specific dsDNA exonuclease/hypothetical protein |
| ? | AP009048 | 1419129 = | 56 (0.780) | intergenic (‑29/+73) | recE/racC | exonuclease VIII, 5' ‑> 3' specific dsDNA exonuclease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTC > AP009048/1419060‑1419199 | tttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAAt > 1:6798638/1‑70 (MQ=255) ttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAAtt < 1:3115732/70‑1 (MQ=255) ttttCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTc > 1:339847/1‑71 (MQ=255) ttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:3622244/1‑71 (MQ=255) ttCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:1522503/1‑71 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:3733647/70‑1 (MQ=255) tCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:1343916/70‑1 (MQ=255) ccGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt > 1:4826392/1‑69 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGt > 1:535850/1‑62 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:797731/70‑1 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:5662807/70‑1 (MQ=255) cGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:1304/70‑1 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:7074385/1‑70 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:552951/1‑70 (MQ=255) tAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTg < 1:7895751/71‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATAAAAATTCGtttt > 1:4873639/1‑62 (MQ=255) ggAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGa > 1:1936511/1‑71 (MQ=255) aaGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGttt > 1:5282926/1‑55 (MQ=255) gagTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:5749554/59‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:5933040/1‑60 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt > 1:3073509/1‑60 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCtt < 1:1316535/70‑1 (MQ=255) agTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTg < 1:4579412/71‑1 (MQ=255) ttGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATa > 1:5359058/1‑71 (MQ=255) gtgCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATaca > 1:2224000/1‑71 (MQ=255) tgCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATacac < 1:2025253/71‑1 (MQ=255) tgCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATaca < 1:5540801/70‑1 (MQ=255) tgCTCATTGGTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTCCCg < 1:4289300/64‑1 (MQ=255) gCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTc < 1:4345899/46‑1 (MQ=255) cTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:3862137/44‑1 (MQ=255) cTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATacacac < 1:1245126/71‑1 (MQ=255) tCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACt > 1:1818110/1‑71 (MQ=255) aTTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:1117837/1‑38 (MQ=255) aTTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATa > 1:7379771/1‑63 (MQ=255) ttGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTg < 1:230125/69‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt < 1:608219/71‑1 (MQ=255) ttGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt < 1:7768459/71‑1 (MQ=255) tGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGc > 1:2763017/1‑55 (MQ=255) tGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt < 1:6094627/70‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAATTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt > 1:5456717/1‑69 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:6286354/1‑35 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:7387003/1‑35 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:1318884/1‑35 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:6295332/1‑35 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGtttt > 1:3785552/1‑35 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:2216080/38‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGtt < 1:7396504/38‑1 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCt > 1:4069428/1‑51 (MQ=255) gTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt > 1:3616213/1‑69 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:4195131/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:2452000/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa < 1:2418613/70‑1 (MQ=255) ttttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCAt < 1:3711894/71‑1 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa < 1:6512435/38‑1 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCa > 1:2178596/1‑38 (MQ=255) tttttAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCa > 1:4915653/1‑69 (MQ=255) ttttaatctgagttgaggttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAg < 1:2104090‑M2/47‑1 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATg > 1:6441897‑M1/1‑44 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACTCACTGTTCATAg < 1:5640187‑M1/71‑1 (MQ=255) TTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAg < 1:7690508‑M1/71‑1 (MQ=255) tttaatctgagttgatgttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGa < 1:3029649‑M2/17‑1 (MQ=255) tttaatctgagttgaggttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGa < 1:4458882‑M2/17‑1 (MQ=255) tttaatctgagttgaggttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGa < 1:6155337‑M2/17‑1 (MQ=255) TTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt < 1:3942001‑M1/38‑1 (MQ=255) TTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt < 1:7703226‑M1/38‑1 (MQ=255) TTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGt < 1:5590028‑M1/38‑1 (MQ=255) TTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCg < 1:3842612‑M1/52‑1 (MQ=255) ttaatctgagttgaggttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGcc > 1:2634548‑M2/23‑71 (MQ=255) TTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGc > 1:2313813‑M1/1‑70 (MQ=255) AACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTg > 1:3470683‑M1/1‑36 (MQ=255) AACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTg > 1:5397851‑M1/1‑36 (MQ=255) ACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTg > 1:4003256‑M1/1‑70 (MQ=255) ACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTg > 1:312114‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTgcgc < 1:4394258/71‑1 (MQ=255) tCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTgcac > 1:7880917/1‑68 (MQ=255) cAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCa > 1:1527885/1‑71 (MQ=255) aaCTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATacaca > 1:4974604/1‑51 (MQ=255) cAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATaca > 1:4640810/1‑45 (MQ=255) cAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATaca > 1:7929213/1‑45 (MQ=255) cAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATAc > 1:6150263/1‑69 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGa < 1:5744726/40‑1 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGa < 1:5850861/40‑1 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACg > 1:3158347/1‑69 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACg > 1:805503/1‑69 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGc < 1:6871955/70‑1 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGc < 1:365504/70‑1 (MQ=255) aGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCa < 1:5101352/71‑1 (MQ=255) aTTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCg < 1:6396356/36‑1 (MQ=255) aTTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCg < 1:5589136/36‑1 (MQ=255) ttaaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATa < 1:1603116‑M2/46‑1 (MQ=255) taaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt > 1:6686710‑M2/6‑47 (MQ=255) taaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGtt > 1:2747869‑M2/6‑47 (MQ=255) aaaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTgc < 1:6631574‑M2/52‑1 (MQ=255) aaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGcc > 1:6814785‑M2/4‑52 (MQ=255) aaaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGcc > 1:3630947‑M2/4‑52 (MQ=255) aaTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAtt > 1:1882347‑M2/3‑71 (MQ=255) aTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAgg < 1:579651‑M2/64‑1 (MQ=255) aTTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAttt < 1:2831413‑M2/70‑1 (MQ=255) ttCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAtttc > 1:1486857/1‑71 (MQ=255) ttCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTAtttc < 1:4695402/71‑1 (MQ=255) | TTTTTCGCTTTCCGTAACAGGAAGAGTGGTTTTGTGCTCATTGTTTTTTAACCTCAACTCAGATTAAAATTCGTTTTGTTCAGTGAATGATCTTGCCGGATACACACTGTTCATAGCCTGCGCCATACGCAGGCTATTTC > AP009048/1419060‑1419199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |