| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 871374 | 66 (0.810) | 6 (0.080) | 3/86 | NT | 9.4% | intergenic (+3/‑15) | yliB/yliC | predicted peptide transporter subunit/predicted peptide transporter subunit |
| ? | AP009048 | = 871389 | 58 (0.810) | coding (1/921 nt) | yliC | predicted peptide transporter subunit | |||||
GGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTT > AP009048/871322‑871459 | ggATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgc < 1:5223535‑M2/71‑4 (MQ=255) tCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgctta > 1:786770‑M2/1‑65 (MQ=255) aTGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAt > 1:2706764/1‑71 (MQ=255) tGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAtt < 1:5933002/71‑1 (MQ=255) tGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAtt < 1:1855785/71‑1 (MQ=255) tGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAtt < 1:204373/71‑1 (MQ=255) tGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAtt < 1:144202/71‑1 (MQ=255) tGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAtt < 1:2631730/71‑1 (MQ=255) aGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACg < 1:6190951/70‑1 (MQ=255) acacCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGaa > 1:6635024/1‑56 (MQ=255) cacCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgc < 1:4498538‑M2/58‑4 (MQ=255) cacCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTAt < 1:2636357/71‑1 (MQ=255) acCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTAt > 1:784440/1‑70 (MQ=255) gCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTa > 1:414955/1‑65 (MQ=255) gCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTa > 1:835496/1‑65 (MQ=255) cAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGc < 1:836427/69‑1 (MQ=255) cAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCt < 1:5031387/70‑1 (MQ=255) cAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCt < 1:6323736/70‑1 (MQ=255) cAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCt < 1:5646913/70‑1 (MQ=255) cTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACt > 1:4495084/1‑71 (MQ=255) tttGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAAt < 1:4565485‑M2/43‑2 (MQ=255) tttGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTg > 1:5354776/1‑71 (MQ=255) tttGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTg > 1:6109749/1‑71 (MQ=255) tttGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTg > 1:2762667/1‑71 (MQ=255) ttGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTgg > 1:614925/1‑71 (MQ=255) gAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTggg < 1:3053691/70‑1 (MQ=255) aaGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTa > 1:7010829/1‑64 (MQ=255) gACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGtt > 1:7896878/1‑70 (MQ=255) aCGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGa < 1:5718550/71‑1 (MQ=255) cgcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTGATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGAt < 1:4608776/71‑1 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAt < 1:6389212/41‑1 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAAt < 1:1577365/41‑1 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACt > 1:2106844/1‑61 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGtt > 1:941314/1‑67 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGa > 1:7509215/1‑69 (MQ=255) gcgGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGAtt > 1:5562158/1‑71 (MQ=255) ggATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTcc < 1:5240773/71‑1 (MQ=255) gATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCg < 1:6022777/71‑1 (MQ=255) aTTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGa < 1:5279088/71‑1 (MQ=255) tttGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGtt > 1:505219/1‑62 (MQ=255) tttGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTg > 1:2518469/1‑63 (MQ=255) tGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACg < 1:4916165/70‑1 (MQ=255) tGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACg < 1:7099218/70‑1 (MQ=255) gCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCaaa > 1:7840437/1‑45 (MQ=255) cAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgcttattgcaaatccgcgtcttcaaagctgaa > 1:2568285‑M2/1‑24 (MQ=255) cAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt < 1:7107117/70‑1 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgcttattgcaaatccgcgtcttcaaagctgaagcc > 1:7802236‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgcttattgcaaatccgcgtcttcaaagctgaagcc > 1:2793945‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgcttattgcaaatccgcgtcttcaaagctgaag > 1:5500989‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGGAAtgcttattgcaaatccgcgtcttcaaagctgaag > 1:4497109‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTgggg < 1:6657757/55‑1 (MQ=255) aaTAAGCAACGCAGGGAGTGAAAtgcttattgcaaatccgcttcttcaaagctgaag > 1:2740273‑M2/1‑23 (MQ=255) aTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCa < 1:2912735/40‑1 (MQ=255) aTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCa < 1:5250764/40‑1 (MQ=255) aTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCa < 1:866748/40‑1 (MQ=255) aTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCa < 1:5092590/40‑1 (MQ=255) aTAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCa < 1:6307962/40‑1 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGTAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGtt > 1:6484845/1‑70 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATc > 1:2462268/1‑38 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTa > 1:6206228/1‑47 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTa > 1:3631489/1‑47 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTa > 1:5585398/1‑47 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGa > 1:3503097/1‑63 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGa > 1:6555261/1‑63 (MQ=255) tAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGa > 1:5332638/1‑63 (MQ=255) aaGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt > 1:6297273/1‑66 (MQ=255) aaGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt > 1:3350038/1‑66 (MQ=255) aaGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt > 1:355118/1‑66 (MQ=255) aaGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt > 1:3520365/1‑66 (MQ=255) aaGCAACGCA‑GGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCt > 1:3573672/1‑65 (MQ=255) aGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTggg > 1:2863418/1‑50 (MQ=255) cAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCaaa > 1:6255204/1‑37 (MQ=255) aCGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTgg < 1:6066360/45‑1 (MQ=255) aCGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTgg < 1:6340536/45‑1 (MQ=255) aCGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGtc > 1:905697/1‑71 (MQ=255) gCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGt > 1:610349/1‑61 (MQ=255) gCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGt > 1:3998758/1‑61 (MQ=255) tGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTggt < 1:151432/36‑2 (MQ=255) tGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTggg < 1:903797/36‑1 (MQ=255) ggAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGgt > 1:7041068/1‑71 (MQ=255) gtaTGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGttt < 1:7506677/51‑1 (MQ=255) gAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGgtg > 1:6264401/1‑71 (MQ=255) aaTGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGgtgt < 1:6541830/71‑1 (MQ=255) aTGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGtt < 1:2616999/71‑1 (MQ=255) | GGATCATGCCAGACACCGGCTTCAGCTTTGAAGACGCGGATTTGCAATAAGCAACGCAGGGAGTGGAATGCTTAATTACGTTATCAAACGCTTACTGGGGTTGATTCCGACGCTGTTTATCGTCTCGGTGCTGGTGTT > AP009048/871322‑871459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |