| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 1284510 = | 98 (1.200) | 6 (0.080) | 3/90 | NT | 6.3% | coding (3070/3744 nt) | narG | nitrate reductase 1, alpha subunit |
| ? | AP009048 | 1284531 = | 87 (1.160) | coding (3091/3744 nt) | narG | nitrate reductase 1, alpha subunit | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAGCCCGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATGCGTGA > AP009048/1284467‑1284601 | cAGCCCGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGa < 1:6394611/69‑1 (MQ=255) aGCCCGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCAc < 1:7764886/66‑1 (MQ=255) gCCCGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAAAGTTCACGAGCTg < 1:1697388/71‑1 (MQ=255) cccGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTg < 1:5877561/70‑1 (MQ=255) cccGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGa > 1:1181715/1‑71 (MQ=255) cccGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGa > 1:2238308/1‑71 (MQ=255) cccGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGa < 1:2056277/71‑1 (MQ=255) cccGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGa < 1:6990845/71‑1 (MQ=255) ggtctggtctGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCt > 1:4835285/1‑61 (MQ=255) ggtctggtctGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATgg > 1:3011293/1‑71 (MQ=255) ggtctggtctGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGCTACACCAACGTTCACGAGc > 1:194457/1‑60 (MQ=255) gtctggtctgGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCt > 1:3487190/1‑60 (MQ=255) gtctggtctgGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGc < 1:3509728/71‑1 (MQ=255) tctggtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTc < 1:3871082/52‑1 (MQ=255) tctggtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATcc > 1:7905627/1‑64 (MQ=255) tctggtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATcc > 1:4942379/1‑64 (MQ=255) tctggtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCg < 1:2236638/71‑1 (MQ=255) gtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGt < 1:1001255/68‑1 (MQ=255) gtctggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTa < 1:3138065/69‑1 (MQ=255) tggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCAt > 1:5540800/1‑60 (MQ=255) tggAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctc > 1:4008656/1‑71 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCa < 1:5513643/57‑1 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCAt > 1:7032612/1‑58 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCAt < 1:3687329/58‑1 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCAt > 1:6685716/1‑58 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc > 1:352904/1‑71 (MQ=255) gAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc > 1:6232578/1‑71 (MQ=255) gAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACg < 1:1693817/40‑1 (MQ=255) gAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACg < 1:2171155/40‑1 (MQ=255) aaCACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgt > 1:6959615/1‑71 (MQ=255) acacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGAt > 1:4592423/1‑45 (MQ=255) acacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTgg > 1:2777367/1‑66 (MQ=255) acacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgt < 1:1447160/70‑1 (MQ=255) acacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgt > 1:1904811/1‑67 (MQ=255) cacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACg > 1:1122872/1‑57 (MQ=255) cacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACg > 1:2799661/1‑57 (MQ=255) cacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACg > 1:5394305/1‑57 (MQ=255) cacGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCa < 1:6531745/71‑1 (MQ=255) cGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtc > 1:4401753/1‑65 (MQ=255) cGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCa > 1:6103429/1‑69 (MQ=255) cGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAg < 1:3066775/70‑1 (MQ=255) gTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGc > 1:3654495/1‑70 (MQ=255) gTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGc > 1:4428944/1‑70 (MQ=255) tttCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGc < 1:6815223/48‑1 (MQ=255) tttCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc < 1:4094511/58‑1 (MQ=255) tttCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCaa < 1:2070843/71‑1 (MQ=255) ttCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCaa < 1:6112331/70‑1 (MQ=255) ttCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAAc > 1:5994113/1‑71 (MQ=255) tCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGa > 1:7673230/1‑37 (MQ=255) tCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctct > 1:1417340/1‑57 (MQ=255) tCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc > 1:7762139/1‑56 (MQ=255) ttACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgtc < 1:5419428/62‑1 (MQ=255) ttACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgtc < 1:2662350/62‑1 (MQ=255) tACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCaa < 1:1911358/66‑1 (MQ=255) tACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTa > 1:340480/1‑71 (MQ=255) aCAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCaa < 1:3066150/65‑1 (MQ=255) aCAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAAc > 1:4195026/1‑66 (MQ=255) cAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATc < 1:3622862/71‑1 (MQ=255) aacgttggtgtaaccggcgttCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctct < 1:4888121‑M2/28‑1 (MQ=255) aacgttggtgtaaccggcgttCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctct < 1:4092035‑M2/28‑1 (MQ=255) AACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCa > 1:6269817‑M1/1‑71 (MQ=255) AACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCa > 1:7195619‑M1/1‑71 (MQ=255) AACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCa > 1:7556008‑M1/1‑71 (MQ=255) ACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAg > 1:1854377‑M1/1‑71 (MQ=255) ACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAg < 1:5230310‑M1/71‑1 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgt < 1:3013535‑M1/55‑1 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgt < 1:503932‑M1/55‑1 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcgt < 1:4317901‑M1/55‑1 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGgtcg > 1:1601840‑M1/1‑54 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAg < 1:2235017‑M1/70‑1 (MQ=255) CGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAg < 1:1362236‑M1/70‑1 (MQ=255) tggtgtaacgggcgttCACGAGCTGATCCCATGGCGTa < 1:4225452‑M2/22‑1 (MQ=255) tggtgtaaccggcgttCACGAGCTGATCCCATGGCGTa < 1:766003‑M2/22‑1 (MQ=255) cGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAgg > 1:5657710/1‑68 (MQ=255) cGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGAt < 1:5867216/70‑1 (MQ=255) ggTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc > 1:5964244/1‑44 (MQ=255) ggTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctctc > 1:3060975/1‑44 (MQ=255) ttACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGAt < 1:1894581/67‑1 (MQ=255) ttACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGAt < 1:3869222/67‑1 (MQ=255) tACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctct > 1:1096520/1‑40 (MQ=255) tACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGctct > 1:3785288/1‑40 (MQ=255) acacCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCa < 1:3940374/70‑1 (MQ=255) acacCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCa < 1:1977476/70‑1 (MQ=255) acacCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCa < 1:6795870/70‑1 (MQ=255) acacCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAg > 1:2822828/1‑71 (MQ=255) acacCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGACGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCa < 1:729033/70‑1 (MQ=255) acCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGct < 1:4671336/35‑1 (MQ=255) acCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAg < 1:4074505/48‑1 (MQ=255) acCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTg < 1:4931454/71‑1 (MQ=255) ccAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTg < 1:3263843/70‑1 (MQ=255) aaCGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGAt < 1:6635667/71‑1 (MQ=255) aCGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAgg > 1:7318906/1‑57 (MQ=255) aCGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGAt > 1:4454824/1‑59 (MQ=255) aCGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTgg > 1:5020289/1‑68 (MQ=255) aCGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATg > 1:2728661/1‑71 (MQ=255) ttCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATGCGt < 1:2523049‑M2/69‑1 (MQ=255) ttCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATGCGt < 1:2968950‑M2/69‑1 (MQ=255) tCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGAt < 1:4969760‑M2/65‑1 (MQ=255) cACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTgg > 1:3897496/1‑63 (MQ=255) cACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATGCGTGa > 1:6320642/1‑71 (MQ=255) | CAGCCCGACCTGGTCTGGTCTGGAAGATGAACACGTTTCTTACAACGCCGGTTACACCAACGTTCACGAGCTGATCCCATGGCGTACGCTCTCTGGTCGTCAGCAACTGTATCAGGATCACCAGTGGATGCGTGA > AP009048/1284467‑1284601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |