| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 3135609 = | 106 (1.300) | 9 (0.120) | 3/90 | NT | 9.4% | coding (1570/1860 nt) | gss | fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
| ? | AP009048 | 3135649 = | 77 (1.030) | coding (1530/1860 nt) | gss | fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTTCACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCGGCTCA > AP009048/3135580‑3135718 | tttCACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGt < 1:7669796/71‑1 (MQ=255) tCACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTg < 1:622351/70‑1 (MQ=255) tCACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGc > 1:6551857/1‑71 (MQ=255) cACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGc < 1:4557621/70‑1 (MQ=255) cACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGc < 1:3177256/70‑1 (MQ=255) cACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCg > 1:3624301/1‑71 (MQ=255) cACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCg > 1:3314836/1‑71 (MQ=255) cTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCgg > 1:2262867/1‑70 (MQ=255) cTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCgg > 1:5990079/1‑70 (MQ=255) cTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCgg > 1:5739373/1‑70 (MQ=255) cGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGaa > 1:5095228/1‑70 (MQ=255) cGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGa < 1:6453197/69‑1 (MQ=255) tAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGaa < 1:5904923/68‑1 (MQ=255) tAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGaa < 1:2026334/68‑1 (MQ=255) cTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGAc > 1:6556293/1‑71 (MQ=255) cTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGAc > 1:3948053/1‑71 (MQ=255) tGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGc < 1:5049377/67‑1 (MQ=255) gTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGAc > 1:385791/1‑69 (MQ=255) ttttCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAAc > 1:6028480/1‑62 (MQ=255) ttttCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCag < 1:4576356/71‑1 (MQ=255) ttttCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCag < 1:2173431/71‑1 (MQ=255) ttCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCagag > 1:4456518/1‑71 (MQ=255) ttCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCaga < 1:1339603/70‑1 (MQ=255) aCCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTg < 1:3574260/50‑1 (MQ=255) aCCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGa < 1:114363/70‑1 (MQ=255) aCCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGAt < 1:1664108/71‑1 (MQ=255) aCCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGAt < 1:4450590/71‑1 (MQ=255) ccAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATc < 1:3238907/71‑1 (MQ=255) gTTCATGATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCg > 1:1025082/1‑57 (MQ=255) gTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCg > 1:3051280/1‑57 (MQ=255) gTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCg > 1:4662159/1‑57 (MQ=255) ttCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCa < 1:1663297/71‑1 (MQ=255) CATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCaga > 1:848849‑M1/1‑60 (MQ=255) CATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCaga > 1:1412468‑M1/1‑60 (MQ=255) CATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCaga > 1:2191340‑M1/1‑60 (MQ=255) ATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGaa > 1:3178529‑M1/1‑71 (MQ=255) cgttacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGa < 1:3434987‑M2/15‑1 (MQ=255) cgttacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGa < 1:3444205‑M2/15‑1 (MQ=255) cgttacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGa < 1:6114426‑M2/15‑1 (MQ=255) cgtcacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGa < 1:318250‑M2/15‑1 (MQ=255) CATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGc > 1:5009280‑M1/1‑50 (MQ=255) atTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCg > 1:5643894/1‑41 (MQ=255) atTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGaa > 1:3064869/1‑45 (MQ=255) atTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACa > 1:7197294/1‑47 (MQ=255) ttacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGAcc > 1:6531624‑M2/36‑52 (MQ=255) ttacctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGAcc > 1:1104132‑M2/36‑52 (MQ=255) ttAACCGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGAc < 1:4962575/51‑1 (MQ=255) ttAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGa > 1:525116/1‑50 (MQ=255) ttAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGc < 1:4351615/71‑1 (MQ=255) aaCAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt < 1:6976874/70‑1 (MQ=255) aaCAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt < 1:2067453/70‑1 (MQ=255) cctgctggataccgatttcactgttaatgatgGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCttt > 1:2981111‑M2/33‑71 (MQ=255) aCAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCttt > 1:6744149/1‑71 (MQ=255) gTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGGGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGc < 1:3649432/65‑1 (MQ=255) gTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGc < 1:254438/65‑1 (MQ=255) aaaTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTttgt > 1:1666717/1‑67 (MQ=255) aaaTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGc < 1:4973299/70‑1 (MQ=255) aaTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGc < 1:2299430/61‑1 (MQ=255) aaTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCg > 1:4996883/1‑71 (MQ=255) aaTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGAAGAATCGCTTTGTTGCCg > 1:4506381/1‑71 (MQ=255) aTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTttg < 1:4181858/64‑1 (MQ=255) aTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTttg < 1:4106075/64‑1 (MQ=255) aTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCg > 1:5546906/1‑70 (MQ=255) aTCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCg > 1:2864779/1‑70 (MQ=255) tCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt > 1:7567132/1‑60 (MQ=255) tCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt > 1:3350786/1‑60 (MQ=255) tCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCggg < 1:1885680/71‑1 (MQ=255) tCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCggg > 1:812121/1‑71 (MQ=255) cGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTTCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt < 1:6176395/59‑1 (MQ=255) cGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt < 1:4245425/59‑1 (MQ=255) cGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCggg > 1:3617785/1‑70 (MQ=255) cGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCggg > 1:2537819/1‑70 (MQ=255) ggTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGa < 1:3782185/71‑1 (MQ=255) ggTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGa > 1:6994193/1‑71 (MQ=255) ggTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGa < 1:5733683/71‑1 (MQ=255) ggTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGa < 1:7694625/71‑1 (MQ=255) gTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGAt < 1:2131757/71‑1 (MQ=255) tATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATc < 1:2572805/71‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTttgt > 1:3077368/1‑59 (MQ=255) tCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCAc > 1:7299527/1‑71 (MQ=255) tCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCAc < 1:1670878/71‑1 (MQ=255) cagcagGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCg < 1:3282866/71‑1 (MQ=255) agcagGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGa < 1:5928917/45‑1 (MQ=255) gcagGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTc < 1:701853/71‑1 (MQ=255) ggTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCcac < 1:1357803/71‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCttt < 1:1133556/48‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCt < 1:7277600/46‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCAcc < 1:4809270/64‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCAcc < 1:4434745/64‑1 (MQ=255) gTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCAcc < 1:3711983/64‑1 (MQ=255) tAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCa < 1:7147865/37‑1 (MQ=255) aCGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTttgtt > 1:5523553/1‑48 (MQ=255) aCGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCg < 1:149338/71‑1 (MQ=255) aCGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCg > 1:2545387/1‑71 (MQ=255) cGATGGTGCGGTAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCtt < 1:6459184/43‑1 (MQ=255) cGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCtt < 1:1241436/43‑1 (MQ=255) cGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCgg < 1:222218/71‑1 (MQ=255) gatgGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATc > 1:3548279‑M2/5‑56 (MQ=255) gatgGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCGGc < 1:6856627‑M2/67‑1 (MQ=255) gatgGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCGGc < 1:6410206‑M2/67‑1 (MQ=255) | TTTCACTGCGTAACCTGTTTTCACCAGTTCATCATTAACAGTGAAATCGGTATCCAGCAGGTAACGATGGTGCGGGAACAGCGACCAGAGGATCGGCAGAATCGCTTTGTTGCCGGGGATCACCGTCCACAGCGGCTCA > AP009048/3135580‑3135718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |