| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1032435 = | 91 (1.480) | 14 (0.300) +TTTCATTTAATT |
9/74 | NT | 26.4% | intergenic (+68/‑205) | blr/ydgT | beta‑lactam resistance membrane protein/predicted regulator |
| ? | Exported | 2331379 = | 13 (0.210) | intergenic (‑284/+146) | sodA/fdhD | superoxide dismutase, Mn/formate dehydrogenase formation protein | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCA > Exported/1032366‑1032502 | aaGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAg > 1:469978/1‑71 (MQ=255) aGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAg > 1:3891550/1‑70 (MQ=255) aGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAg > 1:601466/1‑70 (MQ=255) ctctGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa < 1:3627443/71‑1 (MQ=255) ctctGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGaa < 1:1457802/71‑1 (MQ=255) ttttcttttttcatttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAAtt > 1:4206228‑M1/65‑71 (MQ=255) tGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAt < 1:1708845/69‑1 (MQ=255) tcttttttcatttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATttat < 1:3089464‑M1/10‑1 (MQ=255) cACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATttat > 1:4601061/1‑71 (MQ=255) cACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATtta < 1:5280808/70‑1 (MQ=255) cACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATtta < 1:4711705/70‑1 (MQ=255) aCTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATttatt < 1:1510473/71‑1 (MQ=255) tttttcatttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATtta > 1:991937‑M1/59‑67 (MQ=255) tttttcatttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATtta > 1:3637616‑M1/59‑67 (MQ=255) tgtgGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCTGGAATTTATTATc > 1:5493762/1‑71 (MQ=255) tgtgGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc > 1:2592406/1‑71 (MQ=255) gtgGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc < 1:1747952/70‑1 (MQ=255) gtgGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCt > 1:971217/1‑71 (MQ=255) gtgGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCt > 1:2571601/1‑71 (MQ=255) atttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATttatt < 1:1952751‑M1/11‑1 (MQ=255) gCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTc > 1:199698/1‑71 (MQ=255) ttattatgttcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATttatt > 1:2449052‑M1/51‑61 (MQ=255) cGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCg < 1:582891/71‑1 (MQ=255) cGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCg < 1:3263927/71‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAttt < 1:431453/56‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAttt < 1:1727611/56‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAttt < 1:1056571/56‑1 (MQ=255) aCATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATttat > 1:4633543/1‑58 (MQ=255) aTGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc > 1:2584188/1‑60 (MQ=255) aTGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtgt < 1:3976163/71‑1 (MQ=255) tgctgcCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtgtt > 1:2770506/1‑71 (MQ=255) gctgcCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtgttg > 1:1618409/1‑71 (MQ=255) ctgcCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtgttg < 1:2676367/70‑1 (MQ=255) atgcCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTc > 1:2633734/2‑63 (MQ=255) tcactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATTTATTATcttc < 1:2799766‑M1/17‑2 (MQ=255) cccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATgttgtt < 1:878531/69‑1 (MQ=255) cccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATgttgtt < 1:943752/69‑1 (MQ=255) cccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATgttgtt < 1:3273446/69‑1 (MQ=255) cccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGttgttg < 1:2325106/70‑1 (MQ=255) cactctcttatctatatatttataaggcaattaaatgaaaa < 1:4838721‑M1/1‑1 (MQ=255) ccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGt < 1:5398152/71‑1 (MQ=255) ccGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGt < 1:1415905/71‑1 (MQ=255) gTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGt < 1:4201714/69‑1 (MQ=255) cGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAt > 1:1972461/1‑40 (MQ=255) tGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATttatt > 1:5546829/1‑41 (MQ=255) tGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTtattat > 1:2037803/1‑43 (MQ=255) tGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGAtgt < 1:1009742/55‑1 (MQ=255) tGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGa < 1:2823830/64‑1 (MQ=255) cATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAAtt < 1:3812414/35‑1 (MQ=255) tatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATTTATTATc > 1:2871716‑M1/27‑40 (MQ=255) tatatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATTTATTATc > 1:2869360‑M1/27‑40 (MQ=255) tGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc < 1:3173938/40‑1 (MQ=255) tGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATc < 1:3046617/40‑1 (MQ=255) tGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTc < 1:124413/46‑1 (MQ=255) gTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGa > 1:3230227/1‑69 (MQ=255) gTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGa > 1:225748/1‑69 (MQ=255) atatttataaggcaattaaatgaaaAGGAATTtattat > 1:2657724‑M1/26‑38 (MQ=255) ttttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATa < 1:1002028/70‑1 (MQ=255) ttttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAg > 1:4569758/1‑71 (MQ=255) ttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGttgttg > 1:2640590/1‑52 (MQ=255) ttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTg > 1:280361/1‑55 (MQ=255) ttCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGt > 1:4850738/1‑70 (MQ=255) tCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCTATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTa > 1:2734279/1‑70 (MQ=255) tCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTa < 1:778673/70‑1 (MQ=255) ataaggcaattaaatgaaaAGGAATTTATTATCtt < 1:212814‑M1/16‑1 (MQ=255) aCTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTa < 1:3042938/68‑1 (MQ=255) ttGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTaaa > 1:3289072/1‑68 (MQ=255) tGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCa > 1:3404458/1‑56 (MQ=255) gTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGa > 1:3713786/1‑37 (MQ=255) gTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGt > 1:3326073/1‑47 (MQ=255) gTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAgcgc < 1:3947799/70‑1 (MQ=255) tCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTg < 1:4427947/51‑1 (MQ=255) tCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGcgcg < 1:5027881/70‑1 (MQ=255) cGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGt > 1:3119986/1‑70 (MQ=255) ggATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTc > 1:1819365/1‑51 (MQ=255) ggATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCatg < 1:804449/54‑3 (MQ=255) ggATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCa < 1:1362606/52‑1 (MQ=255) ggATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAgg < 1:423190/54‑1 (MQ=255) atatTAAACCAGGAATTTATTATCTTTTTCGAtgt > 1:3501869/1‑35 (MQ=255) atatTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGAt < 1:5313082/55‑1 (MQ=255) tatTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTActc > 1:4002088/1‑71 (MQ=255) tatTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTActc > 1:2179111/1‑71 (MQ=255) ttAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGAt > 1:1104809/1‑42 (MQ=255) ttAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGAt > 1:5543758/1‑42 (MQ=255) ttAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGt < 1:3474279/64‑1 (MQ=255) ttAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGt < 1:1463904/64‑1 (MQ=255) ttAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCtt < 1:5169758/71‑1 (MQ=255) tAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTg > 1:3848395/1‑39 (MQ=255) tAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGa > 1:3172789/1‑40 (MQ=255) tAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGtt > 1:4060115/1‑64 (MQ=255) aaaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTgg > 1:3241223/1‑36 (MQ=255) aaaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTa > 1:4741456/1‑64 (MQ=255) aaaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTAct > 1:532712/1‑66 (MQ=255) aaaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTAct > 1:3159016/1‑66 (MQ=255) aaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCtttt < 1:320116/70‑1 (MQ=255) aaCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTc < 1:683259/71‑1 (MQ=255) aCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCttt > 1:3622011/1‑68 (MQ=255) aCCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCa < 1:5578098/71‑1 (MQ=255) ccAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGa < 1:5569192/46‑1 (MQ=255) ccAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGa < 1:2021797/46‑1 (MQ=255) | AAGCTCTGCACTTGTGGAGCGACATGCTGCCCGTCCGGGTGCATGTTTTCACTTGTCGGATATTAAACCAGGAATTTATTATCTTGTTCGATGTTGTTGGTGATTGTCAGGGATAGTAAAGCGCGTTACTCTTTTCA > Exported/1032366‑1032502 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |