| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 183922 = | 60 (0.980) | 8 (0.160) +TTATAACA |
4/82 | NT | 16.8% | intergenic (+8/‑29) | rnhB/dnaE | ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | Exported | = 296824 | 35 (0.570) | intergenic (+125/‑28) | cof/ybaO | thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
ATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGCTGCTGGCCT > Exported/296755‑296885 | aTTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTaaaa < 1:1603034/70‑1 (MQ=255)aTTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTaaaa < 1:4984336/70‑1 (MQ=255) ttttCTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAaga < 1:4002887/71‑1 (MQ=255) gtggtgTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGaa > 1:4657009/1‑65 (MQ=255) tttAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGaaaaa < 1:5078683/62‑1 (MQ=255) ttAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCtgt > 1:2571937/1‑71 (MQ=255) tAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGaaaaaaa > 1:3450433/1‑62 (MQ=255) aCCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTgg > 1:3430804/1‑69 (MQ=255) aGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGaaa < 1:2226358/48‑1 (MQ=255) aaTAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCtgt > 1:919868/1‑58 (MQ=255) aTAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAATAAATtc > 1:1058374/1‑52 (MQ=255) aTAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGt > 1:4431805/1‑70 (MQ=255) aTAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGt < 1:3417351/70‑1 (MQ=255) tAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTaaaa > 1:1103556/1‑38 (MQ=255) tAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTaaaa > 1:5421779/1‑38 (MQ=255) tAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTgg < 1:2183805/58‑1 (MQ=255) aaTTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGt > 1:3957159/1‑67 (MQ=255) aTTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTa < 1:1613581/68‑1 (MQ=255) gTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATaa < 1:2180737/70‑1 (MQ=255) tCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATaaaa < 1:4904940/71‑1 (MQ=255) tCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATaa < 1:3644457/69‑1 (MQ=255) gTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAt > 1:54019/1‑70 (MQ=255) tGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAtt > 1:3815286/1‑70 (MQ=255) tGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAtt > 1:1891023/1‑70 (MQ=255) tGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAtt > 1:3592382/1‑70 (MQ=255) aTTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTgg < 1:875347/46‑1 (MQ=255) tttCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGAcc < 1:3796685/71‑1 (MQ=255) tCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCg > 1:503269/1‑70 (MQ=255) tCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCg > 1:2350474/1‑70 (MQ=255) cACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGt > 1:5305116/1‑70 (MQ=255) tttAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGa < 1:1511424/39‑1 (MQ=255) tttAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGa < 1:4113715/39‑1 (MQ=255) ttAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAgc > 1:5440792/1‑69 (MQ=255) taaaataaaaTTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTCGAAGGGCTATGTTAGATaa < 1:718944/54‑1 (MQ=255) gaaaataaaattAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccggaat < 1:2783040‑M2/46‑32 (MQ=255) gaaaataaaattAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccggaa > 1:1518840‑M2/2‑16 (MQ=255) gaaaataaaattAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccggaa > 1:5075803‑M2/2‑16 (MQ=255) aaaataaaatTAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccggaatctg > 1:5477462‑M2/1‑15 (MQ=255) aaaataaaatTAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccg > 1:2381897‑M2/1‑15 (MQ=255) aaaataaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAgctgct > 1:4075692/1‑71 (MQ=255) aaataaaatTAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccggaatc < 1:4490896‑M2/46‑33 (MQ=255) aaataaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTa > 1:3240393/1‑42 (MQ=255) aaataaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGctgctg > 1:5523577/1‑71 (MQ=255) aaataaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGctgctg > 1:3732256/1‑71 (MQ=255) aataaaatTAAAAtgttataagtcgagattaagtaaaccgga < 1:285945‑M2/42‑30 (MQ=255) aataaaatTAAAAtgttataagtcgagattaagta < 1:1257799‑M2/35‑23 (MQ=255) ataaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGCTGCTgg > 1:4643065/1‑70 (MQ=255) taaaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTaa < 1:4303202/61‑1 (MQ=255) aaatTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAg > 1:793232/1‑43 (MQ=255) aaaaGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGCTGCTGGCCt > 1:2156348/1‑65 (MQ=255) aaatgttataagtcgagattaagtaaaccggaatctgaaga < 1:2527796‑M2/41‑39 (MQ=255) aaaGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAtt < 1:1947446/45‑1 (MQ=255) aaaGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAAtt < 1:1989499/45‑1 (MQ=255) agagAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGa > 1:2836209/1‑45 (MQ=255) | ATTTTGTGCCGTGGTGTTTAAACCGCACAGAATAAATTGTCGTGATTTCACCTTTAAAATAAAATTAAAAGAGAAAAAAATTCTCTGTGGAAGGGCTATGTTAGATAAAATTGACCGTAAGCTGCTGGCCT > Exported/296755‑296885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |