| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 436833 | 60 (0.980) | 103 (1.680) | 61/98 | NT | 62.6% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | 1803907 = | 63 (1.030) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TTATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTTC > Exported/1803837‑1803977 | tataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGc > 1:2808559/1‑71 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:354619‑M2/7‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:3715837‑M2/7‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:39114‑M2/7‑1 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:2353616/70‑1 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:5228136/70‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt > 1:757107‑M2/61‑70 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt > 1:3588265‑M2/61‑70 (MQ=255) catgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:5593927‑M2/59‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:209864‑M2/58‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:5270447‑M2/58‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:5296391‑M2/14‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:3894464‑M2/57‑70 (MQ=255) cagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGa < 1:4281469‑M2/16‑1 (MQ=255) cgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:624053‑M2/51‑71 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:4512360/71‑1 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:1133360/71‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGaaa > 1:225271‑M2/50‑58 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:1391962‑M2/21‑1 (MQ=255) ttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATa > 1:199900/1‑71 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3019057‑M2/27‑1 (MQ=255) attcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa > 1:2929694‑M2/44‑70 (MQ=255) aaaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa < 1:4298650/70‑1 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:2590410‑M2/41‑53 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATa > 1:5688983‑M2/41‑63 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:923369‑M2/41‑69 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:3688667‑M2/32‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:4741204‑M2/40‑70 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:1285698‑M2/40‑70 (MQ=255) cggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:865384‑M2/33‑1 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggcttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:2379329‑M2/34‑1 (MQ=255) gcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:3303595‑M2/33‑1 (MQ=255) gcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:4184120‑M2/37‑69 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:3315322/47‑1 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg < 1:2897738/53‑1 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg < 1:566049/53‑1 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg < 1:5323844/53‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:3265913‑M2/35‑69 (MQ=255) gaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:276932‑M2/38‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:1516208/46‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:1584590/1‑50 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:5373419‑M2/32‑44 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2557232‑M2/31‑59 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:2977401‑M2/41‑1 (MQ=255) tgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:4446327‑M2/30‑71 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:4720496‑M2/29‑70 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:838482‑M2/42‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:5246627/70‑1 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2683969‑M2/28‑56 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa < 1:4003514‑M2/44‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4745393/68‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa < 1:1489697‑M2/12‑1 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:4872513/1‑45 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:3507641/1‑45 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:4763106/1‑66 (MQ=255) tttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTc < 1:4080951/42‑1 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:159643/61‑1 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1333393/1‑63 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:4231013/1‑71 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt < 1:2401570/70‑1 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt > 1:3186302/1‑70 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTg < 1:5207784‑M2/53‑1 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:5340609‑M2/17‑71 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:4852813‑M2/16‑44 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:724801‑M2/16‑70 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:4832080‑M2/16‑70 (MQ=255) cTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAAc < 1:4780309/71‑1 (MQ=255) gcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTTAAc < 1:227536‑M2/56‑1 (MQ=255) gTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:606727/1‑55 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:4386602‑M2/57‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:1378152‑M2/57‑1 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa < 1:4561155‑M2/59‑1 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg > 1:3879312‑M2/11‑71 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:5472297‑M2/33‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:1402459‑M2/8‑49 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:169182‑M2/8‑49 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:176265‑M2/8‑49 (MQ=255) cTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaa < 1:3962170/71‑1 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAGTGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:3293552‑M2/7‑50 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAGCCAAATGGATAGTTCGt > 1:4998565‑M2/6‑46 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:2227980‑M2/6‑46 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:104581‑M2/6‑46 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACg < 1:5527636‑M2/46‑1 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACg < 1:5631433‑M2/46‑1 (MQ=255) tataTCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:4692935/47‑1 (MQ=255) tataTCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1958577/47‑1 (MQ=255) ctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:5044522‑M2/5‑54 (MQ=255) ctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:4111856‑M2/5‑54 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:2039086/60‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:2742875/1‑70 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaa < 1:2618776/69‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:5531120/1‑71 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:5496121‑M2/4‑39 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:185171‑M2/4‑47 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:2942976‑M2/4‑71 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt > 1:776152/1‑52 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa < 1:701226‑M2/67‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:1302827‑M2/69‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt < 1:4663518‑M2/69‑1 (MQ=255) cGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaa > 1:3240227/1‑65 (MQ=255) | TTATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTTC > Exported/1803837‑1803977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |