| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 775766 = | 40 (0.540) | 8 (0.120) | 4/92 | NT | 16.9% | intergenic (+138/+727) | icd/minE | isocitrate dehydrogenase, specific for NADP+/cell division topological specificity factor |
| ? | Exported | 775793 = | 42 (0.620) | intergenic (+165/+700) | icd/minE | isocitrate dehydrogenase, specific for NADP+/cell division topological specificity factor | |||||
GGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGC > Exported/775696‑775831 | ggTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAgg > 1:1798523/1‑71 (MQ=255) ttATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggtg < 1:752013/71‑1 (MQ=255) tATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggtgg > 1:2798084/1‑71 (MQ=255) aatcaatgaagaccttaaatattaacgagcgtccgccagcaataataaaaagctaaggaatatctatgt > 1:1290308‑M1/68‑69 (MQ=255) aatcaatgaagaccttaaatattaacgagcgtccgccagcaataataaaaagctaaggaatatctatGTgg < 1:3896694‑M1/4‑1 (MQ=255) tCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggtgg > 1:452558/1‑69 (MQ=255) aatgaagaccttaaatattaacgagcgtccgccagcaataataaaaagctaaggaatatctatgt > 1:1054182‑M1/64‑65 (MQ=255) aatgaagaccttaaatattaacgagcgtccgccagcaataataaaaagctaaggaatatctatgt > 1:4374778‑M1/64‑65 (MQ=255) 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GGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGC > Exported/775696‑775831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |