| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 204107 = | NA (NA) | 26 (0.490) | 6/92 | NT | 100% | noncoding (1512/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | Exported | 204119 = | 0 (0.000) | noncoding (1524/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
AATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAcggtt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Exported/204174‑204107‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > Exported/204119‑204193 AATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:372922/71‑1AATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG > 1:1712199/1‑71 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:2270621/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCACTACGGT < 1:1055271/71‑1 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:2346932/1‑70 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:1787985/1‑70 CTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT > 1:377437/1‑70 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |