New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | Exported | 204107 = | NA (NA) | 26 (0.490) | 6/92 | NT | 100% | noncoding (1512/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
? | Exported | 204119 = | 0 (0.000) | noncoding (1524/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
AGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGA > Exported/204051‑204189 | aatctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg < 1:372922‑M2/3‑1 (MQ=255) aatctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:1712199‑M2/69‑71 (MQ=255) atctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt < 1:2270621‑M2/4‑1 (MQ=255) atctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttccactaCGGt < 1:1055271‑M2/4‑1 (MQ=255) tctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:2346932‑M2/67‑70 (MQ=255) tctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:1787985‑M2/67‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:377437‑M2/66‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:3528190‑M2/66‑70 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGt > 1:2122459‑M2/66‑69 (MQ=255) ctgtgtgagcactgcaaagtacgcttcttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:1808109‑M2/65‑69 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:853489‑M2/57‑61 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:2213985‑M2/57‑61 (MQ=255) cactgcaaagtacgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt > 1:1942791‑M2/57‑61 (MQ=255) acgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCg > 1:3675114‑M2/46‑47 (MQ=255) acgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCg > 1:3597656‑M2/46‑47 (MQ=255) cgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:433283‑M2/45‑47 (MQ=255) cgcttctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCgg > 1:320163‑M2/45‑47 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:1249807‑M2/5‑1 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:2457300‑M2/5‑1 (MQ=255) tctttaaggtaaggaggtgatccaaccgcaggttcccctaCGGtt < 1:1624427‑M2/5‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |