| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 808136 = | 50 (0.850) | 6 (0.120) | 3/90 | NT | 12.8% | coding (31/2868 nt) | ycgV | predicted adhesin |
| ? | Exported | 808171 = | 38 (0.730) | intergenic (‑5/+764) | ycgV/ychF | predicted adhesin/predicted GTP‑binding protein | |||||
CAATAGCGCCAAATTTTATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGAT > Exported/808067‑808205 | ggatattaatcattgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTg > 1:726352‑M1/70‑71 (MQ=255) gatattattcattgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTg > 1:2936553‑M1/69‑70 (MQ=255) tattattcattgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTGGTa < 1:2238109‑M1/5‑1 (MQ=255) tattattcattgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTGGTa < 1:2247898‑M1/5‑1 (MQ=255) gcgcCAAATTTTATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTAtt > 1:1264090/1‑71 (MQ=255) cAAATTTTATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTAt < 1:3013492/66‑1 (MQ=255) aaTTTTATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATTTGCTTTGGTATTc > 1:1715676/1‑66 (MQ=255) aTTTTATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATtg < 1:1834048/71‑1 (MQ=255) tgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTGGTAt < 1:3428755‑M1/6‑1 (MQ=255) tgatttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTGGTAt < 1:2188410‑M1/6‑1 (MQ=255) ttATCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTAt > 1:1578784/1‑60 (MQ=255) tttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTgg < 1:3591698‑M1/3‑1 (MQ=255) ttaaacaaaatgacaaaatccatagacccatagtctgggtactatataggagTg < 1:1477599‑M1/2‑1 (MQ=255) aTCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCa < 1:290951/63‑1 (MQ=255) tCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGtgttgt < 1:2847983/71‑1 (MQ=255) tCAGTTGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGtgttgt < 1:785991/71‑1 (MQ=255) tGAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTTAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGAt > 1:3651987/1‑71 (MQ=255) gAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACTATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGa < 1:994301/69‑1 (MQ=255) gAATTGAGGGCGAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTa > 1:3467841/1‑50 (MQ=255) 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tAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTg > 1:752040/1‑46 (MQ=255) tAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGa > 1:612252/1‑47 (MQ=255) aTTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCTATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAcc < 1:1753438/71‑1 (MQ=255) aTTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGGGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAc < 1:1186256/70‑1 (MQ=255) gtctgggtactatataggagTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACt < 1:3303633‑M1/37‑1 (MQ=255) tCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAcc > 1:980053/1‑69 (MQ=255) aGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAg < 1:413031/70‑1 (MQ=255) gCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGa < 1:2960999/70‑1 (MQ=255) gaCGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTAt > 1:247469/1‑70 (MQ=255) cGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:129545/1‑71 (MQ=255) cGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:2813511/1‑71 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Exported/808067‑808205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |