| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 808136 = | 50 (0.850) | 6 (0.120) | 3/90 | NT | 12.8% | coding (31/2868 nt) | ycgV | predicted adhesin |
| ? | Exported | 808171 = | 38 (0.730) | intergenic (‑5/+764) | ycgV/ychF | predicted adhesin/predicted GTP‑binding protein | |||||
GAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTC > Exported/808102‑808241 | gAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCAc < 1:3249029/70‑1 (MQ=255) aaCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTc < 1:2826372/71‑1 (MQ=255) aCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTcc > 1:202863/1‑71 (MQ=255) aCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTcc > 1:1218874/1‑71 (MQ=255) aCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTcc > 1:1246761/1‑71 (MQ=255) aCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTcc > 1:1822803/1‑71 (MQ=255) aCGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTc > 1:2554120/1‑70 (MQ=255) cGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCt < 1:719792/71‑1 (MQ=255) ttttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCtata > 1:1589375/1‑69 (MQ=255) tttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg > 1:1357068/1‑71 (MQ=255) tttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg > 1:3214874/1‑71 (MQ=255) tttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg > 1:717754/1‑71 (MQ=255) ttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg < 1:1876725/70‑1 (MQ=255) ttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg < 1:452737/70‑1 (MQ=255) ttAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAg < 1:3288203/70‑1 (MQ=255) aTTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCTATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAcc < 1:1753438/71‑1 (MQ=255) aTTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGGGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAc < 1:1186256/70‑1 (MQ=255) gtctgggtactatataggagTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACt < 1:3303633‑M1/37‑1 (MQ=255) tCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTAcc > 1:980053/1‑69 (MQ=255) aGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAg < 1:413031/70‑1 (MQ=255) gCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGa < 1:2960999/70‑1 (MQ=255) gaCGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTAt > 1:247469/1‑70 (MQ=255) cGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:2813511/1‑71 (MQ=255) cGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:129545/1‑71 (MQ=255) cGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATAACACTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:3348346/1‑71 (MQ=255) cTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTa > 1:1358110/1‑71 (MQ=255) gCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATg > 1:1021142/1‑71 (MQ=255) gCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATg > 1:183554/1‑71 (MQ=255) cTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCt < 1:3022162/67‑1 (MQ=255) tttGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGa > 1:717037/1‑71 (MQ=255) agtggtatgggcatcaaacaacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGAc < 1:3303633‑M2/20‑1 (MQ=255) ttGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGAt > 1:2160757/1‑71 (MQ=255) tggtatgggcatcaaacaacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGAtt < 1:3589764‑M2/36‑1 (MQ=255) TGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGa < 1:716730‑M1/54‑1 (MQ=255) TGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGa < 1:140705‑M1/54‑1 (MQ=255) TATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTg > 1:602433‑M1/1‑71 (MQ=255) tCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGAc < 1:2532111/49‑1 (MQ=255) tCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGAc < 1:1044216/49‑1 (MQ=255) ccATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGTATTTTGTCAtt < 1:3458488/71‑1 (MQ=255) ccATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCAt < 1:3243332/70‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTa < 1:2594599/47‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTa < 1:1643539/47‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTa < 1:161282/47‑1 (MQ=255) ttgttTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTAt < 1:1914151/50‑1 (MQ=255) caacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:630222‑M2/20‑45 (MQ=255) caacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:3591973‑M2/20‑45 (MQ=255) caacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:1439794‑M2/20‑45 (MQ=255) caacacaatgggaataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATggg > 1:1001385‑M2/20‑45 (MQ=255) ttGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACt > 1:2988981/1‑36 (MQ=255) ttGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTa > 1:715755/1‑66 (MQ=255) ttGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTa > 1:2233349/1‑66 (MQ=255) ttGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAAt > 1:3713152/1‑69 (MQ=255) tGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCGGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCaa > 1:3153097/1‑71 (MQ=255) tGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCaa > 1:250436/1‑71 (MQ=255) gATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTAt < 1:1826851/44‑1 (MQ=255) aTGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAAt < 1:327627/70‑1 (MQ=255) tGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGa < 1:1054137/71‑1 (MQ=255) gCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTaaa < 1:892708/63‑1 (MQ=255) gCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTaaa < 1:1208409/63‑1 (MQ=255) cccATACCACTCCTATAAAGTACCCACACTATGCGTCTATGGATTTTGTCAt < 1:3231208/52‑1 (MQ=255) ccATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTAt < 1:783949/39‑1 (MQ=255) ccATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCaa < 1:1717417/65‑1 (MQ=255) ataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCa < 1:3428755‑M2/56‑1 (MQ=255) ataccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCa < 1:2188410‑M2/56‑1 (MQ=255) taccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAataata < 1:2247898‑M2/66‑1 (MQ=255) taccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAataata < 1:2238109‑M2/66‑1 (MQ=255) ccaCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTaaa < 1:3591698‑M2/53‑1 (MQ=255) caCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTaa < 1:1477599‑M2/52‑1 (MQ=255) caCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGATTAATATcc > 1:726352‑M2/3‑71 (MQ=255) caCTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATc > 1:2936553‑M2/3‑70 (MQ=255) cTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCctc > 1:1776670/1‑71 (MQ=255) | GAACGGATTTTTAATTCAGCGAGACGATCTGCTTTGGTATTCCCATTGTGTTGTTTGATGCCCATACCACTCCTATATAGTACCCAGACTATGGGTCTATGGATTTTGTCATTTTGTTTAAATCAATGAATAATATCCTC > Exported/808102‑808241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |