| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1037327 = | 87 (1.470) | 10 (0.190) | 5/92 | NT | 11.9% | coding (495/1059 nt) | rsxD | predicted inner membrane oxidoreductase |
| ? | Exported | 1037353 = | 70 (1.320) | coding (521/1059 nt) | rsxD | predicted inner membrane oxidoreductase | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GGTTACCGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCTTAGGTATTGATGGCATTAGTCAGGCGACACCGC > Exported/1037257‑1037397 | ttACCGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCa < 1:292205/71‑1 (MQ=255) gacagaggttttaaatgtatccagcggtgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCa < 1:2590161‑M1/3‑1 (MQ=255) gacagaggttttaaatgtatccagcggtgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCa < 1:2590526‑M1/3‑1 (MQ=255) cagaggttttaaatgtatccagcggtgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATa > 1:403328‑M1/67‑71 (MQ=255) aCCGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATa > 1:3497721/1‑71 (MQ=255) ccGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATa < 1:2787347/70‑1 (MQ=255) ccGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATa < 1:2011923/70‑1 (MQ=255) ccGCCACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATAc < 1:221004/71‑1 (MQ=255) ccACATGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGc < 1:976938/71‑1 (MQ=255) cacaTGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGc > 1:2222411/1‑70 (MQ=255) aTGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGcc < 1:47538/68‑1 (MQ=255) aTGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGcc < 1:1875750/68‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtg > 1:3062683/1‑71 (MQ=255) tGAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtg > 1:2748996/1‑71 (MQ=255) gAAATTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGc > 1:2748034/1‑65 (MQ=255) aaaTTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtgg < 1:2323229/70‑1 (MQ=255) aaaTTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtgg < 1:1443406/70‑1 (MQ=255) aTTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtgg < 1:923260/71‑1 (MQ=255) aTTGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtgg < 1:2165262/71‑1 (MQ=255) ttGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtggt > 1:1004283/1‑71 (MQ=255) ttGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtggt > 1:1563280/1‑71 (MQ=255) tGCGGTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtggt > 1:1713662/1‑70 (MQ=255) gTCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAgtggtg > 1:3536013/1‑64 (MQ=255) tCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGatat > 1:2704325/1‑70 (MQ=255) tCAACATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGatat > 1:993314/1‑70 (MQ=255) cggtgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGata > 1:1760820‑M1/45‑67 (MQ=255) aaCATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGaa > 1:3478763/1‑71 (MQ=255) aaCATCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGaa > 1:1250890/1‑71 (MQ=255) 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1:2862072/1‑71 (MQ=255) tgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATg > 1:276703‑M1/42‑66 (MQ=255) tgtcgcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATg > 1:329806‑M1/42‑66 (MQ=255) tCCCTGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGata > 1:2637760/1‑63 (MQ=255) gcctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGa > 1:1224718‑M1/38‑63 (MQ=255) tGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATa > 1:2541159/1‑41 (MQ=255) tGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCa > 1:3382756/1‑47 (MQ=255) tGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCa > 1:3060922/1‑47 (MQ=255) tGGTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCa > 1:315917/1‑47 (MQ=255) ggTTTTATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACg > 1:2312734/1‑71 (MQ=255) ctgactaatgccatcaatacctaagcgtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAac < 1:1107560‑M1/28‑1 (MQ=255) ctgactaatgcaatcaatacctaagagtagtgtgtTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAac < 1:3656547‑M1/28‑1 (MQ=255) ttttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCAt < 1:1435074/37‑1 (MQ=255) ttttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCAt < 1:635532/37‑1 (MQ=255) ttttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAg < 1:39279/45‑1 (MQ=255) ttttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAg < 1:49919/45‑1 (MQ=255) ttttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCt < 1:3259190/71‑1 (MQ=255) ttATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCtt < 1:3291707/70‑1 (MQ=255) tATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCa > 1:3065084/1‑41 (MQ=255) tATCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCa > 1:2865758/1‑41 (MQ=255) tCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCTTAgg > 1:197690/1‑70 (MQ=255) tCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCTTAgg > 1:1797931/1‑70 (MQ=255) tCGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCTTAgg < 1:166156/70‑1 (MQ=255) cGACGCCATCCAGGTTATTTTTAGCGGTCATACCGCCAGTGGTGGTGATATGAACACACTACGCTTAGGTa > 1:1418159/1‑71 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |