| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1999373 = | 38 (0.640) | 7 (0.170) | 3/72 | NT | 24.2% | intergenic (‑242/+50) | pitB/gss | phosphate transporter/fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
| ? | Exported | 1999408 = | 17 (0.410) | intergenic (‑277/+15) | pitB/gss | phosphate transporter/fused glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase | |||||
ACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTA > Exported/1999303‑1999442 | actggtcatcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaac > 1:3291511‑M1/71‑71 (MQ=255) tAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTa > 1:1823864/1‑71 (MQ=255) catcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacccc < 1:2406908‑M1/4‑1 (MQ=255) catcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCGTa < 1:381137‑M1/7‑1 (MQ=255) atcaaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaaCCCCg > 1:3857‑M1/64‑68 (MQ=255) atatatTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACt < 1:265285/71‑1 (MQ=255) aaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacc < 1:3552847‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaaaagagagtgatattgaaccgttaattgtggtgaaaaagtaatacatgttgtagcaacc < 1:2189024‑M1/2‑1 (MQ=255) 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tatTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACtttt > 1:488484/1‑71 (MQ=255) tatTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACttt > 1:2427485/1‑70 (MQ=255) ttttGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACttttt < 1:2195700/70‑1 (MQ=255) tAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa > 1:2597069/1‑71 (MQ=255) tAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa > 1:472416/1‑71 (MQ=255) aaTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa < 1:1722259/70‑1 (MQ=255) aaTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACaa < 1:871092/70‑1 (MQ=255) aTCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAAt > 1:2063295/1‑70 (MQ=255) tCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAAtt > 1:1737761/1‑70 (MQ=255) tCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTa < 1:2451943/71‑1 (MQ=255) CCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACAt < 1:2309114‑M1/47‑1 (MQ=255) | ACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTA > Exported/1999303‑1999442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |