| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Exported | = 2751796 | 56 (0.950) | 6 (0.120) | 3/90 | NT | 11.7% | coding (801/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| ? | Exported | = 2751807 | 41 (0.790) | coding (812/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit | |||||
AGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTA > Exported/2751727‑2751866 | agagAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCCCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCT > 1:2121330‑M1/1‑70 (MQ=255) agaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAAc > 1:1111720/1‑71 (MQ=255) gaAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACt < 1:3536892/71‑1 (MQ=255) aCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGcc > 1:1445713/1‑71 (MQ=255) aCCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGcc > 1:3045846/1‑71 (MQ=255) cAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCtt < 1:3589716/71‑1 (MQ=255) agagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa < 1:1617193/71‑1 (MQ=255) gagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTaa > 1:1530474/1‑62 (MQ=255) gagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa > 1:3247775/1‑70 (MQ=255) gagTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa > 1:1714720/1‑70 (MQ=255) agTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa > 1:3716926/1‑69 (MQ=255) agTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa > 1:701229/1‑69 (MQ=255) aGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAa > 1:546638‑M2/1‑70 (MQ=255) gTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAag < 1:3161614‑M2/71‑3 (MQ=255) gTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATATGGAATTGACTGTCCGCTATGCTAACTGCCTTAAa > 1:1404502‑M2/1‑69 (MQ=255) ttCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCT < 1:356771‑M1/57‑1 (MQ=255) ttCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCT < 1:2768742‑M1/57‑1 (MQ=255) cgatccgatcCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagca > 1:3150946‑M2/1‑66 (MQ=255) 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tccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc > 1:1065784/1‑71 (MQ=255) tccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATc > 1:128652/1‑71 (MQ=255) cccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTa < 1:271131/59‑1 (MQ=255) cccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTa < 1:2438964/59‑1 (MQ=255) cccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTa < 1:2812584/59‑1 (MQ=255) ccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTttaaggcagttagcaga < 1:602418‑M1/53‑18 (MQ=255) ccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTttaaggcagttagcaga < 1:3236001‑M1/53‑18 (MQ=255) ccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTttaaggcagtt < 1:3298149‑M1/47‑12 (MQ=255) ccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTttaaggcagtt < 1:2096051‑M1/47‑12 (MQ=255) ccTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTttaaggcagtt < 1:1127988‑M1/47‑12 (MQ=255) cTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa < 1:2084386/45‑1 (MQ=255) cTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTa < 1:312312/45‑1 (MQ=255) 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AGAGAAACCAGAGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTA > Exported/2751727‑2751866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |