| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | Exported | = 2751807 | 41 (0.790) | coding (812/990 nt) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit | |||||
AGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCT > Exported/2751738‑2751874 | aGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAa > 1:546638‑M2/1‑70 (MQ=255) gTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAag < 1:3161614‑M2/71‑3 (MQ=255) gTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATATGGAATTGACTGTCCGCTATGCTAACTGCCTTAAa > 1:1404502‑M2/1‑69 (MQ=255) cgatccgatcCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagca > 1:3150946‑M2/1‑66 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagcag > 1:2793416‑M2/1‑65 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagcag > 1:2091609‑M2/1‑65 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagcag > 1:374708‑M2/1‑65 (MQ=255) gatccgatccTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAagcag > 1:1465211‑M2/1‑65 (MQ=255) 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(MQ=255) | AGTTCGATCCGATCCTGCTGCGCCCTGTTGACGATCTGGAATTGACTGTCCGCTCTGCTAACTGCCTTAAAGCAGAAGCTATCCACTATATCGGTGATCTGGTACAGCGTACCGAGGTTGAGCTCCTTAAAACGCCT > Exported/2751738‑2751874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |