| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 1401133 | 42 (0.710) | 9 (0.170) | 3/90 | NT | 20.7% | intergenic (+134/‑278) | yeiU/spr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/predicted peptidase, outer membrane lipoprotein |
| ? | Exported | = 1401140 | 32 (0.610) | intergenic (+141/‑271) | yeiU/spr | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/predicted peptidase, outer membrane lipoprotein | |||||
ATCTATCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTAAAACCGC > Exported/1401071‑1401206 | aTCTATCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACttt > 1:2387636/1‑70 (MQ=255) tATCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaatt < 1:99095‑M2/71‑5 (MQ=255) tATCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaatt < 1:1419426‑M2/71‑5 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaat > 1:1084858‑M2/1‑65 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaat > 1:2481171‑M2/1‑65 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa > 1:1113806‑M2/1‑65 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa > 1:422747‑M2/1‑65 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa > 1:2943477‑M2/1‑65 (MQ=255) tCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa > 1:2306456‑M2/1‑65 (MQ=255) gAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGAcc < 1:237212/71‑1 (MQ=255) gAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGAc > 1:1558798/1‑70 (MQ=255) gAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGAc > 1:2406642/1‑70 (MQ=255) aaCGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCa < 1:941252/71‑1 (MQ=255) aaCGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGCTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCa < 1:1883279/71‑1 (MQ=255) aCGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCaa > 1:696684/1‑71 (MQ=255) gCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACttt < 1:613890/59‑1 (MQ=255) gCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACttt < 1:3191757/59‑1 (MQ=255) aaaaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAAcccc < 1:3375594/71‑1 (MQ=255) aaaaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAAcccc > 1:1989562/1‑71 (MQ=255) aaaaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAAcccc < 1:3379982/71‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGTCCAACCCCg < 1:1209283/71‑1 (MQ=255) aaaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCg < 1:1203840/71‑1 (MQ=255) aaaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCg < 1:1301451/71‑1 (MQ=255) aaaTCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACttt < 1:2232565/55‑1 (MQ=255) tCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCtta < 1:694628/71‑1 (MQ=255) aTTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACttt < 1:2368935/50‑1 (MQ=255) aTTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCttatt < 1:560595/71‑1 (MQ=255) aTTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCttatt < 1:3275128/71‑1 (MQ=255) tctcTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa < 1:93279‑M2/50‑3 (MQ=255) tctcTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaa < 1:1752728‑M2/50‑3 (MQ=255) tctAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaatt > 1:1537636‑M2/1‑46 (MQ=255) tctAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTaatt > 1:331074‑M2/1‑46 (MQ=255) tAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACt < 1:1572046/65‑1 (MQ=255) tAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACt < 1:1510321/65‑1 (MQ=255) aaaTGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGAcc < 1:1974233/47‑1 (MQ=255) atgaatgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCaa > 1:3099363/1‑47 (MQ=255) atgaatgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCaa > 1:912947/1‑47 (MQ=255) gaatgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGc < 1:698276/51‑1 (MQ=255) aatgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACt < 1:2158455/71‑1 (MQ=255) aatgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACt > 1:3095953/1‑71 (MQ=255) tgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCttatt > 1:58347/1‑53 (MQ=255) tgGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCttat > 1:451046/1‑52 (MQ=255) ggATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACtttt > 1:2684417/1‑71 (MQ=255) ggATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACtttt > 1:2682155/1‑71 (MQ=255) ggATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACtttt > 1:3507498/1‑71 (MQ=255) ttGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCt > 1:719256/1‑71 (MQ=255) cATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTAt < 1:1606224/58‑1 (MQ=255) aTGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTtata < 1:2682585/71‑1 (MQ=255) tGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAAc > 1:3417338/1‑47 (MQ=255) cGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATaaaa < 1:2860843/71‑1 (MQ=255) tttCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTc < 1:3352401/47‑1 (MQ=255) ttCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACttt < 1:3510931/45‑1 (MQ=255) cTCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattcatttacttagagaatgatttttgcgttc < 1:1771635‑M2/70‑57 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:551996‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:28995‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:3229771‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:3073224‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:1362306‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:1697499‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattc > 1:1879289‑M2/1‑13 (MQ=255) tCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATg > 1:395007/1‑70 (MQ=255) aaTTGTACTTTaattgagtgaaacgcatgcaatccattcat < 1:556716‑M2/41‑31 (MQ=255) aaTTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTaa < 1:3691232/71‑1 (MQ=255) aaTTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTaa < 1:88026/71‑1 (MQ=255) aaTTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTa < 1:2178029/70‑1 (MQ=255) ttGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTaaaa > 1:2959750/1‑71 (MQ=255) tACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATg < 1:557233/63‑1 (MQ=255) cTTTTATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCt < 1:994203/47‑1 (MQ=255) cTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCt < 1:2424825/47‑1 (MQ=255) cTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTAAAACCGc < 1:2720580/70‑1 (MQ=255) cTTTAAATGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCt < 1:3512287/47‑1 (MQ=255) ttAATTGTCCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACtttt < 1:2503215/42‑1 (MQ=255) ttAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACtttt < 1:1795709/42‑1 (MQ=255) tAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTAAAAc > 1:2810779/1‑64 (MQ=255) | ATCTATCGAACGCAAAAATCATTCTCTAAGTAAATGAATGGATTGCATGCGTTTCACTCAATTGTACTTTAATTGACCAACCCCGCTTATTAACTTTCTGTATCACTTTTTCTTATAAAAAATCATGTAAAACCGC > Exported/1401071‑1401206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |