| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1607174 = | 23 (0.390) | 4 (0.070) | 3/94 | NT | 16.3% | coding (892/900 nt) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
| ? | Exported | 1607197 = | 20 (0.370) | coding (1044/1053 nt) | yfeG | predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
GGCAGCCCAGAAGCGGCGTTAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGTGGCAA > Exported/1607129‑1607264 | ttttccgagaagccgtcactgacgctgcataagaggatgcgggagTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCAc > 1:3396590‑M1/46‑69 (MQ=255) aaGCGGCGTTAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGc < 1:2371593/71‑1 (MQ=255) gTTAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATg > 1:17911/1‑69 (MQ=255) gTTAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATg > 1:2531886/1‑69 (MQ=255) tAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGAt > 1:3348633/1‑66 (MQ=255) aaGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGc < 1:3104570/70‑1 (MQ=255) aaGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCg > 1:1760380/1‑71 (MQ=255) aGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGt < 1:2909006/71‑1 (MQ=255) taAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCCCCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGc > 1:384976/1‑58 (MQ=255) aGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTtc < 1:821605/71‑1 (MQ=255) ggTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCg < 1:1674505/45‑1 (MQ=255) ggTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCg < 1:2066344/45‑1 (MQ=255) tCAGGGATTGTGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCtt < 1:3506358/67‑1 (MQ=255) gggATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGa > 1:3192227/1‑70 (MQ=255) aTTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAAc < 1:2183370/71‑1 (MQ=255) aTTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAAc < 1:1587030/71‑1 (MQ=255) aTTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAAc < 1:1369570/71‑1 (MQ=255) aTTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAAc < 1:1073552/71‑1 (MQ=255) gtgggggtgagggagttacacccaCTCCCGCATCCTCTTATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGaaaa > 1:3396590‑M2/25‑69 (MQ=255) GGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCa < 1:817304‑M1/48‑1 (MQ=255) ggggtgagggagttacacccaCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTtct < 1:2685216‑M2/38‑1 (MQ=255) gggtgagggagttacacccaCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGc > 1:1857599‑M2/21‑54 (MQ=255) gggtgagggagttacacccaCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGc > 1:2784856‑M2/21‑54 (MQ=255) aaCTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACgg > 1:1082835/1‑49 (MQ=255) aCTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTgg > 1:608254/1‑70 (MQ=255) cTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATcc < 1:2532699/71‑1 (MQ=255) tCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTaa > 1:2853529/1‑67 (MQ=255) cACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACg > 1:116607/1‑40 (MQ=255) cACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGt > 1:2059395/1‑71 (MQ=255) aCCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGt < 1:1218217/70‑1 (MQ=255) aCCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCAGCTGGTAATCCGTg > 1:1035846/1‑71 (MQ=255) ccccACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGTGGc < 1:900336/71‑1 (MQ=255) cccaCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGTGGCa < 1:2459882‑M2/67‑1 (MQ=255) ccaCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGTGGCaa < 1:857315‑M2/68‑1 (MQ=255) aCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTaa > 1:3554060‑M2/2‑59 (MQ=255) aCTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTaa > 1:2432957‑M2/2‑59 (MQ=255) | GGCAGCCCAGAAGCGGCGTTAAGTGAGTTTATTAAGGTCAGGGATTGGGTGTAACTCCCTCACCCCCACTCCCGCATCCGCTGATGCAGCGTCAGTGACGGCTTCTCGGAAAACAGCTGCTGGTAATCCGTGGCAA > Exported/1607129‑1607264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |