New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | Exported | 2478469 = | 63 (1.070) | 3 (0.060) | 3/86 | NT | 6.1% | coding (442/774 nt) | pstB | phosphate transporter subunit |
? | Exported | 2478497 = | 40 (0.800) | coding (470/774 nt) | pstB | phosphate transporter subunit |
TTGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAGCAACAGCGTCTGTGTATTGCGCGTGGTATCGCCATTCGCCCGGAAGTGCTGCTGCTCGACGAACCG > Exported/2478427‑2478567 | ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAGCGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1743989/1‑71 (MQ=255) ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1066092/1‑71 (MQ=255) ttGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg < 1:2074354/71‑1 (MQ=255) tGACCAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCtggtgg > 1:1928767/1‑70 (MQ=255) gACCAAAGCCGCATTGTTGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTggtggt > 1:3521126/1‑70 (MQ=255) ccAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:89919/1‑71 (MQ=255) ccAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:2801410/1‑71 (MQ=255) cAAAGCCGCATTGTGGAACGAAACCAAAGATAAATTGCACCAGAGCGGTTACTCTCTCTCTGGTGGTCAg > 1:2831310/1‑70 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |