| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Exported | 2684350 = | 41 (0.790) | intergenic (‑66/‑162) | greB/ompR | transcription elongation factor/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with EnvZ | |||||
TTCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGAATCAATAATGTTTCGCCGAATAAATTGTATACTTAAGCTGCTGTTTAATATGCTTTGTAACAATTTAG > Exported/2684280‑2684417 | ttCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGaa > 1:2767963/1‑71 (MQ=255)ttCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGaa > 1:1174600/1‑71 (MQ=255)ttCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGaa > 1:3697468/1‑71 (MQ=255)ttCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGaa > 1:2449818/1‑71 (MQ=255)ttCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGaa > 1:1848149/1‑71 (MQ=255) tCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACATaa < 1:2355053/70‑1 (MQ=255) cATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGAAt > 1:1523338/1‑70 (MQ=255) cATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGAAt < 1:3704051/70‑1 (MQ=255) 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TTCATCTCGTTGATTCCCTTTGTCTGTTTGATAATGCGCACATTGGGTATAACGTGATCATATCAACAGAATCAATAATGTTTCGCCGAATAAATTGTATACTTAAGCTGCTGTTTAATATGCTTTGTAACAATTTAG > Exported/2684280‑2684417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |