| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2844980 | 62 (1.050) | 4 (0.070) | 3/96 | NT | 6.3% | coding (676/978 nt) | poxA | predicted lysyl‑tRNA synthetase |
| ? | Exported | = 2845032 | 61 (1.100) | coding (728/978 nt) | poxA | predicted lysyl‑tRNA synthetase | |||||
TCACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGAATTGACGGATGCCCGTGAGCAGCAACAACGCTTTGAACAAGATAA > Exported/2844965‑2845101 | tCACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtg > 1:3588383‑M2/1‑68 (MQ=255) cACTGGCGCAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAg > 1:40148/1‑71 (MQ=255) gcgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:599333/69‑1 (MQ=255) gcgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTg < 1:1182952/69‑1 (MQ=255) cgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCg < 1:2425502/71‑1 (MQ=255) cgcAAATCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCg < 1:1110731/71‑1 (MQ=255) aaaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAAt > 1:1182228/1‑71 (MQ=255) aaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATg > 1:987678/1‑71 (MQ=255) aaTCAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATg < 1:3260072/71‑1 (MQ=255) cAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGtt > 1:2375773/1‑71 (MQ=255) cAGTACCGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGtt > 1:1415781/1‑71 (MQ=255) ccGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcc > 1:891189‑M2/1‑49 (MQ=255) ccGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcc > 1:1434462‑M2/1‑49 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:2232437/71‑1 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:3288165/71‑1 (MQ=255) cGAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATg < 1:3620157/71‑1 (MQ=255) gAAGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATtgatttgcgccagtgatgcctg < 1:1618580‑M2/69‑23 (MQ=255) aaGATCATCGGGTCGCTGAACGCTTTGAGGTTTATTATAAAGGTATTGAGCTGGCGAATGGTTTCCATGaa > 1:3034821/1‑71 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |