| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 1938044 | 41 (0.700) | 4 (0.080) | 3/88 | NT | 10.2% | intergenic (‑16/‑322) | zwf/yebK | glucose‑6‑phosphate dehydrogenase/predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | AP009048 | = 1938057 | 35 (0.690) | intergenic (‑29/‑309) | zwf/yebK | glucose‑6‑phosphate dehydrogenase/predicted DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
TTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAG > AP009048/1937975‑1938114 | tttCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGT > 1:4414265‑M1/1‑70 (MQ=255) ttCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGtt > 1:1374963/1‑70 (MQ=255) tCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaa > 1:3229218/1‑71 (MQ=255) tCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTta < 1:930531/70‑1 (MQ=255) gcCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaactaa < 1:1251227/71‑1 (MQ=255) gcCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaactaa < 1:1721838/71‑1 (MQ=255) aaaTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaacta < 1:34103/65‑1 (MQ=255) aaaTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCgg > 1:1788205/1‑71 (MQ=255) aaaTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCgg > 1:228275/1‑71 (MQ=255) aaTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCgg > 1:5312085/1‑70 (MQ=255) aTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTaccgggttagttaa < 1:4375666‑M1/71‑15 (MQ=255) tGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaa > 1:2439282/1‑59 (MQ=255) aCCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTaccgggttagttaact > 1:4221935‑M1/1‑54 (MQ=255) ccAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTactta > 1:619509‑M2/1‑66 (MQ=255) ccAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTactt < 1:3879995‑M2/70‑5 (MQ=255) ccAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTactt < 1:4110195‑M2/70‑5 (MQ=255) ggTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGc < 1:83776/71‑1 (MQ=255) ggTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGc > 1:3414619/1‑71 (MQ=255) gTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaactaa > 1:3786395/1‑56 (MQ=255) gTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGc > 1:2785621/1‑70 (MQ=255) tCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGc > 1:4757190/1‑69 (MQ=255) tCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTAAACTAACCCGGTACTTAAGCCa < 1:19652/71‑1 (MQ=255) cacaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAg > 1:3058713/1‑71 (MQ=255) acaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGtt > 1:2142958/1‑47 (MQ=255) acaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTaccgggttagttaa < 1:3572021‑M1/60‑15 (MQ=255) acaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAAcc > 1:2589133/1‑55 (MQ=255) caGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAggg < 1:4453346/71‑1 (MQ=255) aGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAggg > 1:4246941/1‑70 (MQ=255) ccTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGtata > 1:162563/1‑71 (MQ=255) cTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATAc > 1:3703994/1‑71 (MQ=255) cTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATAc < 1:2397256/71‑1 (MQ=255) ggCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaacta > 1:3405626/1‑43 (MQ=255) ggCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACt < 1:845781/69‑1 (MQ=255) tttGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGt > 1:144321/1‑59 (MQ=255) tttGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAAtt < 1:1492882/71‑1 (MQ=255) tGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCa > 1:3432540/1‑53 (MQ=255) tGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAAtttt > 1:2883041/1‑71 (MQ=255) tGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAAttt < 1:486836/70‑1 (MQ=255) tGCGTTACCGCCATGTCACTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAAttt > 1:4537796/1‑70 (MQ=255) cGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGcc < 1:2355659/50‑1 (MQ=255) gTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTaccgggttag < 1:2045746‑M1/37‑11 (MQ=255) gTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCt < 1:4720915/70‑1 (MQ=255) aCCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCa > 1:3743863/1‑47 (MQ=255) aCCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCa > 1:1865992/1‑47 (MQ=255) aCCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACg > 1:5118042/1‑71 (MQ=255) cGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGt < 1:4850651/71‑1 (MQ=255) cATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGcc < 1:4381050/41‑1 (MQ=255) tGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGtat < 1:719366/46‑1 (MQ=255) tCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAg > 1:51244/1‑39 (MQ=255) tCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGt < 1:961969/71‑1 (MQ=255) aTTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCt < 1:1487814/56‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTTCGGTGCACTGTActtctt < 1:5013832/70‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCttt < 1:1581543/71‑1 (MQ=255) cTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCtt < 1:3081059/70‑1 (MQ=255) tAAGTaccgggttagttaacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgtgacctgg > 1:619509‑M1/1‑5 (MQ=255) tAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATAc > 1:1194389/1‑36 (MQ=255) aaGTaccgggttagttaacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgtgacctgg < 1:4110195‑M1/70‑67 (MQ=255) aaGTaccgggttagttaacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgtgacctgg < 1:3879995‑M1/70‑67 (MQ=255) aaGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCtttt < 1:909620/69‑1 (MQ=255) aaGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTa > 1:3639846/1‑70 (MQ=255) aGTTAACTAACCCGGTacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgtgacctggt > 1:4221935‑M2/1‑16 (MQ=255) gTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTAc < 1:3443436/60‑1 (MQ=255) ttAACTAACCCGGTacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgtgacctggtcat < 1:4375666‑M2/71‑58 (MQ=255) ttAACTAACCCGGTacttaaggagaatgacatggcggtaacgcaaacagcccaggcctgt < 1:3572021‑M2/60‑47 (MQ=255) | TTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAG > AP009048/1937975‑1938114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |