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tatTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtggcgcaatatcttccggtttgaagacccgaatagctttacaacctaaaccttccgctacttttacgtggtcaaccccgtagccattcacttcactggagttgatattctcgaa < 2:589823‑M2/149‑115 (MQ=255) tatTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACg > 2:595244/1‑149 (MQ=255) atTGCGCCAttaaggctttcgcctgttcaaaggctggcgcaatatcttccggtttgaagacccgaatagctttacaacctaaaccttccgctacttttaagtggtcaacaacgtagccattcacttcactggagatgatattctcgaaa > 2:627498‑M1/1‑9 (MQ=255) ttGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCa < 1:1364749/149‑1 (MQ=255) ttGCGACACACTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATAGCGGGAACCGGTAGTCGTGGAAGTTAATCACGCGCTGGTGACCAATATTTCGATAGGGAGCGAACTGAAAAACGTCTAGGAATTCGAAGATATCGCCGATAACGCa > 2:276079/1‑149 (MQ=255) tGCGCCAttaaggctttcgcctgttcaaaggctggcgcaatatcttccggtttgaagacccgaatagctttacaacctaaaccttccgctacttttacgtggtcaacaccgtagccattcacttcactggagttgatattctcgaaagc < 2:737471‑M1/149‑143 (MQ=255) cgcCAttaaggctttcgcctgttcaaaggctggcgcaatatcttccggtttgaagccccgaatagctttacaacctaaaccttccgctacttttacgtggtcaacaccgtagccattcacttcactggagttgatattctcgaaagcga > 1:145912‑M1/1‑5 (MQ=255) cgcCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCg > 1:1370174/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACAAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCg < 2:433373/149‑1 (MQ=255) ccAttaaggctttcgcctgttcaaaggctggcgctatatcttccggtttgaagacccgaatagctttacaacctaaaccttccgctacttttacttggtcaacaccgtagccattcacttcactggagttgatattctcgaaagcgagt < 2:158613‑M1/149‑147 (MQ=255) ccAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGCGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATCTCGCCGATAACGCAGCggc > 1:778064/1‑148 (MQ=255) ccAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCgtc > 1:784525/1‑147 (MQ=255) | GCGCTTTTGACATGGACTACTGCGTGCAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGA > NC_000913/535366‑535660 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |