| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGCA > NC_000913/535391‑535687 | gCAACTCGCTTTCGATAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGGGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGGTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTaa < 2:367543/149‑1 (MQ=255) aagtCGCTTTAGAGAATATCAACTCGAGTGAAGTGTATGGCTACCGTGTTGACCAGGTAAAAGTAGCTGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTATTAAAACCGGAAGATATTGCGCCATCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATg < 2:569929/146‑1 (MQ=255) aaCTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAAtg < 1:570699‑M2/149‑3 (MQ=255) 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tatTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACg > 2:595244/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTAGCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGACGATAACGCa > 1:1517103/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCa < 1:1364749/149‑1 (MQ=255) ttGCGACACACTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATAGCGGGAACCGGTAGTCGTGGAAGTTAATCACGCGCTGGTGACCAATATTTCGATAGGGAGCGAACTGAAAAACGTCTAGGAATTCGAAGATATCGCCGATAACGCa > 2:276079/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCg > 1:1370174/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACAAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCg < 2:433373/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGCGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATCTCGCCGATAACGCAGCggc > 1:778064/1‑148 (MQ=255) ccAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCgtc > 1:784525/1‑147 (MQ=255) gCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGc < 2:607602/149‑1 (MQ=255) ccTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGAACCGGTAGTCGTCGAAGTTATTCTAGAGCGTGAGACCAATATATCCAAGGGCAGAGAACAGCAAAAAGTCATTGAAATTGAAGATAACCACTATAACGCATCTGAcaca > 2:1150334/1‑149 (MQ=255) cTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCAc > 1:1334337/1‑149 (MQ=255) cTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCAc < 1:320719/149‑1 (MQ=255) tGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGa < 2:541116/149‑1 (MQ=255) gAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGAc < 1:1173537/149‑1 (MQ=255) aaCAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACt < 1:1207601/149‑1 (MQ=255) aaCAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACt < 2:517343/149‑1 (MQ=255) aCAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACtt > 2:388295/1‑148 (MQ=255) ggCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGaaa < 2:372496/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGCGTTAATGGCGCAATATCGGCTACCGGTAGTAGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACAGGATACCGGCATGGAATTTGATGATATCGGCGATAACGCCTCGGACGCACCGACTGAAAc > 2:844904/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGAGGGGCAGCGAACGGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGc > 2:1316350/1‑149 (MQ=255) aGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCTGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCt < 1:23661/149‑1 (MQ=255) ccTTAATGGGGCAATATCGGGTTCCGGTAGTCGTGGATGTTATTCACGAGCGTGTGACCAATATTTCGTTGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATAACGCCGATATCGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTc < 1:1499317/149‑1 (MQ=255) ccTTAATGGAGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTc > 2:1213324/1‑149 (MQ=255) cTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCa > 1:541972/1‑149 (MQ=255) ttAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCAt > 1:452283/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCCTGGAAGTTATTCTCGAGCTTGTGACCAATAATTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCATCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGCa < 1:1471265/149‑1 (MQ=255) | GCAACTCGCTTTCGAGAATATCAACTCCAGTGAAGTGAATGGCTACGGTGTTGACCACGTAAAAGTAGCGGAAGGTTTAGGTTGTAAAGCTATTCGGGTCTTCAAACCGGAAGATATTGCGCCAGCCTTTGAACAGGCGAAAGCCTTAATGGCGCAATATCGGGTACCGGTAGTCGTGGAAGTTATTCTCGAGCGTGTGACCAATATTTCGATGGGCAGCGAACTGGATAACGTCATGGAATTTGAAGATATCGCCGATAACGCAGCGGACGCACCGACTGAAACCTGCTTCATGCA > NC_000913/535391‑535687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |