New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 730045 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/266 | NT | NA | coding (463/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 730067 | NA (NA) | coding (485/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
GTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGG > NC_000913/729999‑730214 | gtgGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt < 2:983946/149‑1 (MQ=32) gtgGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt < 2:1189708/149‑1 (MQ=32) gTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCg > 2:64324/1‑149 (MQ=32) ggcgcGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGCCAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCgg < 1:105859/148‑1 (MQ=17) gcgcGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCggg < 2:1167520/149‑1 (MQ=32) ggcggcgTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGTCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACACCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGCCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGcc < 1:1235505/149‑1 (MQ=12) gCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGGGCGGGTGCCGGAAGCGGa > 2:1401790/1‑149 (MQ=17) cGAAACTGGATGCCGGTCCCCCGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGCACTCCGCTTAAGTCCGCCTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCGGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGAt < 1:858770/149‑1 (MQ=11) aaCTGCATGAAGGGCTCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCCTCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCGGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAg < 2:95748/149‑1 (MQ=11) actgtcagAAGGGCACCGGCTGGCCGCACACTTGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTACGGCCGCATCCTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGGGGCTGCTCGGCTGGGGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAgg < 2:376763/142‑1 (MQ=11) aCTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGCACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTGTCTGGCGACCAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGAGGATGCTAGTCTGGTTTGTGCGGGTGCCGTAGGCGGATGAgg > 1:1009486/1‑149 (MQ=11) ggaggaAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGtgc < 2:1219085/149‑1 (MQ=17) ggATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGGCGGAAGCGGATGAGGtgc > 2:245020/1‑149 (MQ=17) aaGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcct > 1:1421309/1‑149 (MQ=32) aGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGctgcctg > 2:1109396/1‑149 (MQ=32) ggTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGCAAGAACTCCGCTTAACTCCGCAACGTTATCTGGCGACAAACACTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGACGTGctgcctgc > 1:1149453/1‑149 (MQ=11) gTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTgcg > 1:437764/1‑149 (MQ=32) gTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTgcg > 2:683567/1‑149 (MQ=32) cACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgcc > 2:80104/1‑149 (MQ=32) aCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGcgccg > 2:357895/1‑149 (MQ=32) cGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCGGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACACACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGCGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCt > 1:261407/1‑149 (MQ=12) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGccgccg > 1:858068/1‑149 (MQ=32) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGccgccg > 1:1262674/1‑149 (MQ=32) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGGGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGccgccg > 1:1012132/1‑149 (MQ=17) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGt > 1:63786/1‑149 (MQ=32) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCg < 1:65370/149‑1 (MQ=17) tctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACGCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACCGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCGCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGACGCGGATGAGGGGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCgg < 2:864176/149‑1 (MQ=11) tGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAACTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGCGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt > 1:649804/1‑149 (MQ=17) gggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGGCCGCATCGTTATCTGGCTACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCGCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGt < 2:291745/148‑1 (MQ=12) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTa < 2:1282785/149‑1 (MQ=32) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTa < 2:737601/149‑1 (MQ=32) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCAGCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGGGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCGGTACCGGGTa < 2:63928/149‑1 (MQ=12) ggCAGGCGCGGCCGGAAGAACTCCGCCTCAGTCCGCAGCGTTATCTGGCGACAAACACTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCGCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTa < 2:43161/149‑1 (MQ=11) cgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCCCATCGTTATCTGGCGACAAACATGCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGATGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGAcc < 1:1529442/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGGGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCgg < 1:824711/149‑1 (MQ=17) | GTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGG > NC_000913/729999‑730214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |