| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3083831 = | 101 (1.250) | 5 (0.070) | 5/278 | 9.5 | 4.8% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
| ? | NC_000913 | 3083868 = | 102 (1.350) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCAA > NC_000913/3083722‑3084014 | aGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAATGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAACGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGGCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGa < 2:941049/149‑1 (MQ=255) gTTCATCGGCAGTCTTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAAACAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCATATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACCAGGAAGGGTTGGAt > 2:728132/1‑149 (MQ=255) gTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGTAAGGGTTGGAt > 2:717305/1‑149 (MQ=255) 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aGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGCCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCATATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCAGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTTTCACAAt > 1:849671/1‑149 (MQ=255) gTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAAt > 1:393430/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATtg > 1:441650/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGCATCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGCGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTgg > 1:1097089/1‑149 (MQ=255) aaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTgg > 2:189062/1‑149 (MQ=255) 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ggTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATc < 1:414095/149‑1 (MQ=255) ttGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCaa > 2:176166/1‑149 (MQ=255) | AGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGCCTCGAACTCTTCAAGGAACTGTTGTTGCAGTTCAGCATCAA > NC_000913/3083722‑3084014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |