| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2700550 = | 138 (0.550) | 8 (0.040) | 6/240 | NT | 6.2% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
| ? | NC_000913 | 2700601 = | 123 (0.560) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTT > NC_000913/2700403‑2700699 | ggcaaaccacggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTaa < 1:1296321‑M1/4‑1 (MQ=255) caaaccacggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTaaaa < 2:2770952‑M1/6‑1 (MQ=255) cGGTCACTTTAATCTGTCCATCAATATTGCATTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCTAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATTATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAA < 2:2536783‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAG < 1:690490‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAG < 1:2649559‑M1/150‑1 (MQ=255) aaccacggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTAAAAAg > 1:344657‑M1/143‑150 (MQ=255) tCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTGGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTA > 2:4150436‑M1/1‑150 (MQ=255) acggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTAAAAAGTaaa < 2:1647720‑M1/12‑1 (MQ=255) acggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTAAAAAGTaaa < 1:204425‑M1/12‑1 (MQ=255) ggctacggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTAAAAAGTAAAAc < 2:1737937‑M1/14‑1 (MQ=255) tAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCC > 1:3858146‑M1/1‑150 (MQ=255) tAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCC > 1:1326533‑M1/1‑150 (MQ=255) acggctatggggcgaggcattaaaactggcggaaaagctgggcgtagcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccaaggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctTTAAAAAGTAAAAacccc < 2:3938845‑M1/18‑1 (MQ=255) aTCTTTCAATCAATATTGCTTTATTCTTAAAGGCTCTAGTTTTTATGCTAAATATTGCAATTTGCTTTTAAAATATAAGTACACTGATCCATAATCGCTTTTGTTGTGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCC < 1:3108492‑M1/150‑1 (MQ=255) tttCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGtt > 2:3884405/1‑150 (MQ=255) ttCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTATAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTc < 2:695337/150‑1 (MQ=255) ttCCATAAATATTGCTTTCTTCGTAATGGCTCTATTTTTTATGCTAAAGTTTGTATGTTGCTTGTAAATGATAAGTACCCTGATCCACATTCGCTGTTTTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAATTAAAACCCCCGTTc < 1:2008897/150‑1 (MQ=255) aTCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTa > 1:3171400/1‑150 (MQ=255) aTCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGAATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTa > 1:3510258/1‑150 (MQ=255) tCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAc > 1:1615095/1‑150 (MQ=255) tCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAc > 1:964091/1‑150 (MQ=255) aaTATTGCTTTCGTCGTAATGGCTCGAGTTTTTATGCTAATGATTGCTTGTTGCTTGTAATAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCa < 2:2631962/150‑1 (MQ=255) atTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGtt < 2:289736/150‑1 (MQ=255) atTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGtt > 1:368269/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTc > 1:21815‑M2/1‑149 (MQ=255) tGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTcg > 2:1106047‑M2/1‑148 (MQ=255) gCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTcgg > 2:1027929‑M2/1‑147 (MQ=255) tttCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTcgggg < 1:838172‑M2/150‑6 (MQ=255) 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gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGGTCCTTACCAGTTcggggggtttactttttcactttaagggtgtgcagcatgcaccctcaacaacagcgagtatggatcagtgtacttatcttttacaagcaccttgcaatctt < 2:3190564‑M2/150‑102 (MQ=255) tgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATAttt < 1:2724915/150‑1 (MQ=255) gcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTg > 1:3326560/1‑150 (MQ=255) cacaAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCCGCGTTACATGCATATTTGc > 1:3307163/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAAc > 2:864119/1‑150 (MQ=255) 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aaaGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAg < 1:1815467/150‑1 (MQ=255) gTTTAACAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCtt < 2:2904381/150‑1 (MQ=255) | TTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTT > NC_000913/2700403‑2700699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |