New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2700550 = | 138 (0.550) | 8 (0.040) | 6/240 | NT | 6.2% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
? | NC_000913 | 2700601 = | 123 (0.560) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC > NC_000913/2700452‑2700746 | tCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAGCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa > 2:428293/1‑150 (MQ=255) cGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAag < 1:2954057/150‑1 (MQ=255) gctgggcgttgcaaatatgcatgtaacgctggcagatgagcggcactatgcttgtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctcgTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAaga > 2:4014638‑M1/97‑150 (MQ=255) gAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAATTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAaga > 2:2614195/1‑150 (MQ=255) ttttATTCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAACCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAAc < 1:2260048/150‑1 (MQ=255) ttttATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAAc < 1:831475/150‑1 (MQ=255) ttATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACgg > 2:766806/1‑150 (MQ=255) cTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtatta < 1:3906144/150‑1 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat > 1:425105/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat > 1:1392393/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat > 2:1003579/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat > 2:1307051/1‑150 (MQ=255) aaGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTAttt > 2:2748778/1‑150 (MQ=255) gATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTAttttt > 1:3253575/1‑150 (MQ=255) aTTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTa > 2:1309110/1‑150 (MQ=255) aTTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTa > 2:1309149/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACACCCGTTCCTTACCAGTTCGGGTGTTTTACTTTTTAAAGAGAACTGTATTATTTTTaaa > 2:2314432/1‑149 (MQ=255) cAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACtt > 2:4111506/1‑150 (MQ=255) acgTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTGGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACttt > 2:2921345/3‑150 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTCCACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACttt < 1:2419004/150‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACttt < 2:3798189/150‑1 (MQ=255) aGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTc < 1:4198972/150‑1 (MQ=255) ttGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCaataat > 1:4273774/1‑150 (MQ=255) 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acacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 1:1857513/150‑1 (MQ=255) acacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGCGTGCATGCTGCACAAAATTAAATTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 1:3981944/150‑1 (MQ=255) cacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCa < 1:3163837/150‑1 (MQ=255) acTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCAt > 1:1024580/1‑150 (MQ=255) cTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATa < 1:2040290/150‑1 (MQ=255) cTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATa < 1:2453930/150‑1 (MQ=255) tGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAAATTTCAATAATAACCGTGGCACAAGCATAg > 2:3169707/1‑150 (MQ=255) cATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAACTTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCg < 2:1211137/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGTCACAAGCATAGTGCCGCTCATc < 2:435973/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCt > 2:3127225/1‑150 (MQ=255) gttgttGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGcc > 1:3648761/1‑150 (MQ=255) ttgttgAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCa < 1:2557232/150‑1 (MQ=255) ttgAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCg > 2:2810164/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGtt < 2:3390984/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGtt > 1:3072147/1‑150 (MQ=255) gggTGCATGCTGCACAAAATAAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTAc < 2:1976086/150‑1 (MQ=255) ggTGCATGCGGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACa < 2:605738/150‑1 (MQ=255) tGCATGCTGCACAAAATTACAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTGACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATg < 2:3658122/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGc > 2:2468973/1‑150 (MQ=255) tgctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCata > 1:264379/1‑150 (MQ=255) 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ccAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCa < 1:3923064/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagcc < 1:22736/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagcc < 1:4150436/150‑1 (MQ=255) cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccg < 2:1341989‑M2/131‑1 (MQ=255) ggggtttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCTTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCTACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgt < 2:3938845‑M2/132‑1 (MQ=255) ggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgta < 2:1687732‑M2/133‑1 (MQ=255) gttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgtagcc < 2:1737906‑M2/136‑1 (MQ=255) ctttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGtt > 1:344657‑M2/9‑150 (MQ=255) tttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGttt > 1:278682‑M2/8‑150 (MQ=255) tttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGc > 1:2052585‑M2/6‑150 (MQ=255) ttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGcc < 2:322580‑M2/146‑1 (MQ=255) ttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGcc < 1:392107‑M2/146‑1 (MQ=255) | TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC > NC_000913/2700452‑2700746 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |