New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1789000 = | 50 (0.840) | 3 (0.050) | 3/266 | NT | 5.6% | coding (566/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
? | NC_000913 | 1789053 = | 53 (0.930) | coding (619/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
CGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACC > NC_000913/1788853‑1789147 | aaactcgtgcagcgtatcgcaggctgcggcgatatcatcggcatgataattccgttatttgccgccacgcaaaataatgtggccatacgggttgccgctggtctgatagatggtcctctgaccatttttgtatggcgagaggaccatat < 1:245592‑M1/2‑1 (MQ=255) actcgtgcagcgtatcgcaggcttcggcgatatcatcggcatgataattcggttttttgccgcaacgcataataatgtggccatacgggttgccgctggtctgatagatcgtcatctgaccatttttgtctggcgagaggaacatATgg > 2:498374‑M1/146‑149 (MQ=255) cGAGGTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCa > 2:923909/1‑149 (MQ=255) tCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATAcg < 1:884425/149‑1 (MQ=255) gATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGAt > 1:731947/1‑149 (MQ=255) gTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCtgt < 2:306048/149‑1 (MQ=255) gTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATACACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTTTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACAGATGGCAATACGCGGATTGCagt > 2:887987/1‑149 (MQ=255) tttATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCcg > 1:389265/1‑149 (MQ=255) catcggcatgataattcggttttttgccgccacgcataataatgtggccatacgggttgccgctggtctgatagatggtcatctgaccatttttgtctgtcgagaggaacatATGGCTGG‑CGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:27673‑M1/113‑149 (MQ=255) ttGCTTATTTAATCAGTTGGTGCGCGATTGGCGAACGTACTACCGAAATTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCTGTAGGTTTTAAAAATGGTAGCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa < 1:403290/149‑1 (MQ=255) cTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGcc > 2:469152/1‑149 (MQ=255) cAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagcc < 1:393402/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAGATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGAGGATTGCTGTGGATGCTATACGCGCAGCCCGCGCCAGCCat > 2:214710/1‑149 (MQ=255) gTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATAAGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCat > 2:634704/1‑149 (MQ=255) ttGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCAACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCata > 2:264245/1‑149 (MQ=255) gttttttgccgcaacgcataataatgtggccatacgggttgccgctggtctgttagatggtcatctgaccatttttgtctggcgagaggaacatATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCatat > 2:913765‑M1/95‑149 (MQ=255) tttttgccgccacgcataatactgtggccatacgggttgccgctggtctgatagatggtcatctgaccagttttgtctggcgagaggaacatATGGCAATACGCGGATTGCGGGGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:630063‑M1/93‑149 (MQ=255) gggCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGCATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:68000/1‑149 (MQ=255) gcgcGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGGCAGATCCCCCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGGCCGGTAGGTTTTAAAACTGGTACCGATGGCACTACGCGGATGGCTGTGGAGGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCAGATGtgc > 1:233872/1‑147 (MQ=255) aTTGGCGCACGTACTACCGAAAGGCAGCACCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCAGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCtctc < 2:268945/149‑1 (MQ=255) gcgcACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATTGCTTAGGCACTCTCCTGTCCGGTATGTTTTAAAAATGGTACAGATGGCAATAAGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCa < 2:458639/149‑1 (MQ=255) cgcACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAATCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGAAGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGGTCCTCTCGCCAg < 2:677671/149‑1 (MQ=255) gcccGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCAGATGTTACTGTCGccgcc > 1:706362/4‑146 (MQ=255) ctacCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAAt < 1:469152/149‑1 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGCTGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 1:297019/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACTCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgga > 2:773806/1‑148 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATggg > 1:33238/1‑148 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 1:301740/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 2:131041/1‑149 (MQ=255) cGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTc < 2:390025/149‑1 (MQ=255) aaaGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg < 1:126938/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGa < 1:923909/149‑1 (MQ=255) gTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGATTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATg > 2:847876/1‑149 (MQ=255) cacaTCCACCGCGAAAGGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAc < 2:431747/146‑1 (MQ=255) gATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATAAGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGCCCa > 1:507341/1‑149 (MQ=255) aTCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt > 1:392743/1‑149 (MQ=255) aCCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCCTCTAt > 1:72087/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATc < 2:587078/149‑1 (MQ=255) cgcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGAGGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCa < 1:981697/149‑1 (MQ=255) gcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTCGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATTCGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAATAATGGTCAGATGACCATCTATCAg < 1:971290/149‑1 (MQ=255) gcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAg > 1:254736/1‑149 (MQ=255) cgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGAAGTTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATCCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGa < 1:738547/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGc < 1:770744/149‑1 (MQ=255) gCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAccc > 2:749401/1‑149 (MQ=255) cACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGCAATGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCACGCCAGACAAAAATGGTCACATGACCAACTAACAGACCAGCGGCCACCCg > 2:245592/1‑149 (MQ=255) tctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTAt < 2:743839/149‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCca > 2:284194/1‑149 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGTCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACat < 1:887987/149‑1 (MQ=255) cGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCACCCCGTATGGCCACatt > 1:99728/1‑149 (MQ=255) cGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCAAGCCATATCTTCCTCTCGCCAGACAAAAATCTTCAGATGCCCATCTATCAGCCCAGCGGCAACCCGTATGGCCACatt > 2:801937/1‑149 (MQ=255) ggTAGGTTTTAAAAATGGTCCCGATGGCAATACTCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCTCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGTCACAAATGGTCAGATGACAATCTATCAGACCAGAGGCACCCCGTATGGCCACatta > 1:847052/1‑149 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCACACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAATATTATGc > 2:617669/1‑149 (MQ=255) tttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATG‑TCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGt > 1:129986/1‑149 (MQ=255) tttaaaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCCACCCGTATGGCCCCAGTATTATGCGt > 2:325776/4‑149 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATTCGAGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAATATGGGCAGATGACCATCTATCAGACCAGCTGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTggcg < 1:219413/149‑1 (MQ=255) ccGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAACTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTAGTATGCGTGGCGGCaaaaaa > 1:319279/1‑149 (MQ=255) gATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAAcc < 2:731947/149‑1 (MQ=255) | CGACCGAGTTCCTCGATATGGTGACCGGTCAGTTTATTGCTGATTTAATCAGTTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACC > NC_000913/1788853‑1789147 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |