New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1789000 = | 50 (0.840) | 3 (0.050) | 3/266 | NT | 5.6% | coding (566/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
? | NC_000913 | 1789053 = | 53 (0.930) | coding (619/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
TTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGCGATACGCTGCACGAGTTT > NC_000913/1788905‑1789199 | ttGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCAACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCata > 2:264245/1‑149 (MQ=255) gttttttgccgcaacgcataataatgtggccatacgggttgccgctggtctgttagatggtcatctgaccatttttgtctggcgagaggaacatATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCatat > 2:913765‑M1/95‑149 (MQ=255) tttttgccgccacgcataatactgtggccatacgggttgccgctggtctgatagatggtcatctgaccagttttgtctggcgagaggaacatATGGCAATACGCGGATTGCGGGGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:630063‑M1/93‑149 (MQ=255) gggCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGCATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:68000/1‑149 (MQ=255) gcgcGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGGCAGATCCCCCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGGCCGGTAGGTTTTAAAACTGGTACCGATGGCACTACGCGGATGGCTGTGGAGGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCAGATGtgc > 1:233872/1‑147 (MQ=255) aTTGGCGCACGTACTACCGAAAGGCAGCACCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCAGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCtctc < 2:268945/149‑1 (MQ=255) gcgcACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATTGCTTAGGCACTCTCCTGTCCGGTATGTTTTAAAAATGGTACAGATGGCAATAAGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCa < 2:458639/149‑1 (MQ=255) cgcACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCAATCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGAAGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGGTCCTCTCGCCAg < 2:677671/149‑1 (MQ=255) gcccGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCAGATGTTACTGTCGccgcc > 1:706362/4‑146 (MQ=255) ctacCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAAt < 1:469152/149‑1 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGCTGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 1:297019/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACTCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgga > 2:773806/1‑148 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATggg > 1:33238/1‑148 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 1:301740/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt > 2:131041/1‑149 (MQ=255) cGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTc < 2:390025/149‑1 (MQ=255) aaaGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg < 1:126938/149‑1 (MQ=255) aaGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGa < 1:923909/149‑1 (MQ=255) gTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGATTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATg > 2:847876/1‑149 (MQ=255) cacaTCCACCGCGAAAGGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAc < 2:431747/146‑1 (MQ=255) gATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATAAGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGCCCa > 1:507341/1‑149 (MQ=255) aTCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt > 1:392743/1‑149 (MQ=255) aCCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCCTCTAt > 1:72087/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATc < 2:587078/149‑1 (MQ=255) cgcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGAGGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCa < 1:981697/149‑1 (MQ=255) gcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTCGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATTCGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAATAATGGTCAGATGACCATCTATCAg < 1:971290/149‑1 (MQ=255) gcgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAg > 1:254736/1‑149 (MQ=255) cgAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGAAGTTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATCCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGa < 1:738547/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGc < 1:770744/149‑1 (MQ=255) gCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAccc > 2:749401/1‑149 (MQ=255) cACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGCAATGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCACGCCAGACAAAAATGGTCACATGACCAACTAACAGACCAGCGGCCACCCg > 2:245592/1‑149 (MQ=255) tctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTAt < 2:743839/149‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCca > 2:284194/1‑149 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGTCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACat < 1:887987/149‑1 (MQ=255) cGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCACCCCGTATGGCCACatt > 1:99728/1‑149 (MQ=255) cGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCAAGCCATATCTTCCTCTCGCCAGACAAAAATCTTCAGATGCCCATCTATCAGCCCAGCGGCAACCCGTATGGCCACatt > 2:801937/1‑149 (MQ=255) ggTAGGTTTTAAAAATGGTCCCGATGGCAATACTCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCTCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGTCACAAATGGTCAGATGACAATCTATCAGACCAGAGGCACCCCGTATGGCCACatta > 1:847052/1‑149 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCACACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAATATTATGc > 2:617669/1‑149 (MQ=255) tttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATG‑TCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGt > 1:129986/1‑149 (MQ=255) tttaaaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCCACCCGTATGGCCCCAGTATTATGCGt > 2:325776/4‑149 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATTCGAGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAATATGGGCAGATGACCATCTATCAGACCAGCTGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTggcg < 1:219413/149‑1 (MQ=255) acatatggctggcgcgggctgcgcggatagcatcccccgcaatccgcgtattgccatATGTTCCTCTCGCCAGACAAAACTGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAGTATTATGCGTGGCGGCaaaaa > 1:630063‑M2/58‑149 (MQ=255) ccGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAACTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTAGTATGCGTGGCGGCaaaaaa > 1:319279/1‑149 (MQ=255) atatggctggcgcgggctgcgcggatagcatccacagcaatccgcgtattgccatATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTAACAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTTGCGGCAAAAAAc > 2:913765‑M2/56‑149 (MQ=255) gATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAAcc < 2:731947/149‑1 (MQ=255) TGGCAATACGCGGATTGCTGTGTATTCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGGAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGa > 1:634704‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGaa > 1:264245‑M1/1‑149 (MQ=255) tACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATc > 1:898317/1‑149 (MQ=255) cgGAGTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGc < 1:214710/149‑1 (MQ=255) gATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCCTCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCg > 2:758088/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCga < 1:284194/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCga > 2:546110/1‑149 (MQ=255) tgcgcggatagcatccacagcaatccgcgccagccatATGTTCCTCTCGACAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCgatg > 1:27673‑M2/38‑149 (MQ=255) tGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGTTGACCATCTATCAGACCAGCGGCATCCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATAATCATGCCgatg < 2:68000/149‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTCTCAGACCAGCGGCACCCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCTAAAAACCGAATTATCATGCCgatgat > 1:839434/1‑149 (MQ=255) cTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCTACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCgatgat < 1:847876/149‑1 (MQ=255) tgtgGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGata > 2:397229/1‑149 (MQ=255) tgtgGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAGTATTATGCGTGGCAGCAAAAAACCGAATTATCATGCAGATGata > 1:961985/1‑149 (MQ=255) tgGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATc > 2:873843/1‑149 (MQ=255) cTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCa < 1:749401/149‑1 (MQ=255) tCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGcc < 1:234432/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGc < 1:131041/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGAAGAACATCTAACAGACCAGCGGCAACCCGTAAGGACTCATTATTATCAGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGACGATGATATCGCCTCAGCCtcc > 1:812836/1‑147 (MQ=255) cagccaTATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCTGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGCGATACGCTGCACg > 1:606651/1‑149 (MQ=255) ccatATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACGATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTTGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGAAGCCTGCGATACGCTGCACGAGt > 2:498374‑M2/5‑149 (MQ=255) atATGGTCCTCTCGCCATACAAAAATGGTCAGAGGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTTTGCGTGGCGGCAAATAACGGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGCGATACGCTGCACGAGttt < 1:245592‑M2/147‑1 (MQ=255) | TTGGGGCGCGATTGGCGCACGTACTACCGAAAGTCAGATCCACCGCGAAATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGTGGCGGCAAAAAACCGAATTATCATGCCGATGATATCGCCGCAGCCTGCGATACGCTGCACGAGTTT > NC_000913/1788905‑1789199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |