New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 781369 = | 43 (0.630) | 15 (0.220) +GAG |
6/270 | NT | 35.0% | noncoding (1/76 nt) | lysZ | tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | = 2521006 | 14 (0.200) | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val |
CAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGA > NC_000913/781221‑781516 | caGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATg < 2:496963/149‑1 (MQ=255) ttttAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGt < 1:912219/149‑1 (MQ=255) ttAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACAACCGTATGGGTCg > 1:260446/1‑149 (MQ=255) tAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCACGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTACCACCCGTATGGGTCGt < 2:448390/149‑1 (MQ=255) cATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATAAAGCACGACCCCCCAATATTAAAGATTGGCCACGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGTTCGTTAg > 1:830552/1‑149 (MQ=25) aTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAATGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTCTCAGGTAACACGCGTATGGGTCGTTAGc > 1:715814/1‑149 (MQ=255) cAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCAGAACGACCACCCAAGCGGAAAGCTAGGCCCCGAGGACAAAGAGTTCTCGGAACACCCGTATGGGGCGTTAGCta > 1:781002/1‑148 (MQ=17) cTCACATGTTAAGCGCGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTATGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAATATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGtt < 2:53480/149‑1 (MQ=255) tCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATATTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTACAGGTAACACCCGTATGGGTCGTGAGGTCAGTTg > 2:244311/1‑149 (MQ=255) tCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATATTAAAGATTGGCCACGAGTAAAAATCTTTCAGTTAACACACGTAAGGCTAGTTAGCTCAGttt > 2:572497/1‑148 (MQ=21) actgcgttgattcattttgaactctccctttaatccgagtcctcacctcgggggtgattagcgcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccacttcGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:782337‑M1/132‑149 (MQ=255) aGATGTTAAGCGTGACGGATAACGTAGCGACAGCAACGGCCCGTAGGTCGAGCGAATCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTATCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt < 2:168578/149‑1 (MQ=25) tcattttgaactctccctataatgcgactccacacagcgggggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccacttcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGtt < 2:487923‑M1/29‑1 (MQ=255) tGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAc < 1:1120258/149‑1 (MQ=255) tAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGCGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAt < 2:709222/149‑1 (MQ=255) acaCGATGCGCCAGAAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGCCATCCAGCACGTCCCACCAATCTTAAAGAGTGGCCCCGAGTAACCATCATTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAt < 1:900654/147‑1 (MQ=37) aaCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGTGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGCCCCACCAAACTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGTGCAGTTTAATc > 1:405247/1‑149 (MQ=37) aaCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAtg > 2:900302/1‑148 (MQ=255) aaCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATAGGCCACGAGTAAAAATATTTCAGTTAACAAGAGTATTGGTAGTTAGCAAAGTTGGTAGAGAAGTTTACTTTTAAtg > 2:16321/1‑148 (MQ=21) aGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGTAGAGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCa < 1:1033252/149‑1 (MQ=255) acacagcgggggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccacttcGGGTCGt < 1:512802‑M1/7‑1 (MQ=255) acacagcgggggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccacttcGGGTCGt > 2:512802‑M1/90‑96 (MQ=255) gggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatccagtcatcacccaccactcGGGTAGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTAGAATCCTGCA‑CGAc < 1:448390‑M1/70‑1 (MQ=255) ggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccggcatcacccacaactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGATCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGTTTCGAATCCTGCA‑CGAcc < 2:912219‑M1/71‑1 (MQ=255) gcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGATGGGAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGAcc > 1:447306/1‑149 (MQ=255) gattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACccac > 2:829332‑M1/76‑149 (MQ=255) aagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATAGGCCACGAGTAAAAATATTTCAGGTAACACACGTATGGGTCGTTAGCTAAGTGGGTATAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGacacac > 2:490276/1‑149 (MQ=25) ttagctcagctgggagagcacctccctttcaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑Cgacccagca < 1:687076‑M1/76‑4 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGATTAAAAATCTTTCATTAAACACCCGTATGGTTGGGTAAGACAATTGGGAGCGAAGTTGAAATTTATACAATTGTTTGCAGATAAGATACCTGCC‑AGACCAACCAAATTAAAggtgg > 2:779442/1‑149 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGTTAACAGCCGTATGGTTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAggtgg < 2:260446/149‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAggtgg > 1:306099/1‑149 (MQ=255) cccACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTGAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTATTAAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTg < 1:244311/149‑1 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa > 2:546350/1‑149 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa > 2:751635/1‑149 (MQ=255) accaATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTa > 2:149454/1‑149 (MQ=255) ccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGtt > 1:128628‑M1/50‑104 (MQ=255) ccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGtt < 2:128628‑M1/55‑1 (MQ=255) cTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGAAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTCGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAAc < 1:60303/149‑1 (MQ=255) ttAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACg > 1:962386/1‑149 (MQ=255) aaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGTTGGTTAGTGGTTGATAACGTg < 2:601234‑M1/106‑1 (MQ=255) aaggATTGGCGCCGAGGTTAGATCCTTCATGTACCAACCTTTGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGAAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTg < 1:572880/146‑1 (MQ=17) aGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGaa > 1:622850/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCCCTAGTATAAATCTTTCAGGTAACACCCGTAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAgg < 1:572497/149‑1 (MQ=255) aTTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGTGACGCTGAAgg > 1:1185469/1‑149 (MQ=25) tcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt > 2:1091121‑M1/34‑96 (MQ=255) tcggcggttcgatcccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt < 1:1091121‑M1/63‑1 (MQ=255) cccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAGAAACTAGGACGCCCGTTCTCA‑ACAGCAGCGACAGACCAATTTAAACTTCCTTAGTGGTAGAGAAAGAGAAGGATAACg > 1:419958/1‑149 (MQ=16) cccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACg > 1:209503/1‑149 (MQ=255) tAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGCCCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTATATAACGGGAAGGATAACGTTGCGt > 1:870478/1‑149 (MQ=255) aaaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt < 1:71152/88‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt > 2:71152/1‑88 (MQ=255) aaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGt > 1:776098/1‑71 (MQ=255) aaaTCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGt < 2:776098/71‑1 (MQ=255) cTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTATAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAc > 1:549610/1‑149 (MQ=255) ccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTc < 1:807426‑M1/48‑1 (MQ=255) ccgtcatcacccaccactcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTc > 2:807426‑M1/20‑67 (MQ=255) attCAGGTAACACAGGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCTGTTGACTTTTAATCAATAGGTCGCAGGTTCGAATCATGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACg < 1:779442/148‑1 (MQ=21) tCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGc > 1:1166234/1‑149 (MQ=255) ggTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGGCCAACCAATTTAAAGTTTGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGCTAACGTTGCGTTAGCAACTGCCCg > 1:1088630/1‑149 (MQ=21) ccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCga < 2:1166234/149‑1 (MQ=255) tcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAg < 2:271819‑M1/84‑1 (MQ=255) tcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAg > 1:271819‑M1/3‑86 (MQ=255) tGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTAAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGa < 1:900302/149‑1 (MQ=255) cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg > 2:143302‑M1/2‑96 (MQ=255) cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTgg < 1:143302‑M1/95‑1 (MQ=255) | CAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA‑CGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGA > NC_000913/781221‑781516 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |